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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003401`

染色体: Chr04 坐标: 50567869-50569304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003401`
名称	SmilChr04G003401
描述	dof zinc finger protein DOF5.4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50567869 - 50569304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020299`
GeneID	`131020299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020299`
原始查询	`LOC131020299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF5.4
产物	dof zinc finger protein DOF5.4
Arabidopsis	`AT5G60850` (OBP4) OBF binding protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836206] identity=42.6; qcov=0.944; evalue=5.1e-52; confidence=medium
Rice	`Os02g0726300` (OsDof4) - identity=93.1; qcov=0.19; evalue=8.51e-36; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805010.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805010.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805010.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805010.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50568432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C5,D2
`Chr4:50568466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:50568480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50568542`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A4,A9,B105,B78,C19,C30,C31,C35,C45,C46,C50,C53,C74
`Chr4:50568554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr4:50568608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr4:50568844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805010.1

306 aa

153

306

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 48-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805010.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	48	104	9.9e-34	116.0	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949027.1
TTGATGACGGATAAGTGAATGCGACCACAGAGTATCTCATGTGATATGAGACCTGATCACTGTCACAAAAATTTTATGTCTCTGCAACCGAATTTCACCAATATTTAATTAGTTAATGCTTCCAAGGGTACACCCGTCATTTTGGCTCTTCACTAAAATATTGGGATTAGAATATTTGCTGGGATATTTGTTTGGGCAGAGGCAGAGAGAGAGAGAGTTCAGTGACTCACATGTCAACACACTGAGCTTTGGCTAATGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020299
ATGCCGGAAAATTGGGTAGTGCTGAACCTAGAGCAGGTCAAATCGTCGAGAATGCAAGATATGCATGGCATTGGAGAAGGAAGCGGCGGCGGAGGGAGGTTTATAAGCGTCGGAGATAGGCGTCTGCGGCCGCTCAACCACCAGGTGGTCAAGTGCCCGCGCTGCGACTCGCTCAACACCAAGTTTTGCTACTACAACAACTACAACCTCTCGCAGCCGCGCCACTTCTGCAAGAGCTGCCGCCGCTACTGGACCAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805010.1
MPENWVVLNLEQVKSSRMQDMHGIGEGSGGGGRFISVGDRRLRPLNHQVVKCPRCDSLNTKFCYYNNYNLSQPRHFCKSCRRYWTKGGVLRNVPVGGGCRKTKRSKPKANASSAAEDDAPPGETKSSAQSSSSESSSLTTAAAAAATAPPTSAEEGSVPIYTTSDSAVMYNFADASFSNVNPLANPSLDHQPAFVNDRPSMAGQIFSAEGGSFTGLMTSSEELMMGLDIATTSYGQEEPAAEKASVGVGKADDLKMEDIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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