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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003399`

染色体: Chr04 坐标: 50518944-50524270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003399`
名称	SmilChr04G003399
描述	uncharacterized SmilChr04G003399
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50518944 - 50524270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020303`
GeneID	`131020303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020303`
原始查询	`LOC131020303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0726400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0726400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G26300` (AT1G26300) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839171] identity=45.2; qcov=1.13; evalue=2.6e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0726400` - identity=50.8; qcov=1; evalue=3.89e-78; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805014.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057805014.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805014.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057805014.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057805014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50520966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B85
`Chr4:50522747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50523925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:50523944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77
`Chr4:50523945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B119,B45,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805014.1

259 aa

130

259

BSD

PF03909 BSD 131-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805014.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	131	177	5.8e-11	42.9	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949031.1
TTGATTGTAAGAAAGGAGTTATTTTGAATATTTAGCCAAAAATAAAAGTGGGTAAAATACTTGGTCGCAATACGTAGCAAACAATCTAATCCAAATTCCAATTTCCGCAGCAGTAAATTCTACTAAGTCCACTCTCGTTTTCCGCAATCCCGATCGTCCATGGACATCTGGAACAGAGCTCGCACCTTCGCCGAGGAAGCGGCCAAGAAATCGCAGGAGCTCAGGCAGACCATCGCCGCCACCAACCTCTCTGACGTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020303
ATGGACATCTGGAACAGAGCTCGCACCTTCGCCGAGGAAGCGGCCAAGAAATCGCAGGAGCTCAGGCAGACCATCGCCGCCACCAACCTCTCTGACGTCGTCTCCGAGGCCTCCAAGCGCTCCAAGGAGCTCGCCGCCGAGGCTCTCAAGCGCGCTGATCAGATCACCGCTCAGATTCCGCCCGCCGCCGCTGCCATTACCAGTCTCGTCGACTCCACCGCTTCCAAGCCCGGCATTGACGCTGCCGATCTCGACAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805014.1
MDIWNRARTFAEEAAKKSQELRQTIAATNLSDVVSEASKRSKELAAEALKRADQITAQIPPAAAAITSLVDSTASKPGIDAADLDKYGVTDELREFVKEITMNTFQDFPLQDDSEVSDVPTVSNIRQDLTEWQEKHAKLVLLTVKEVSKLRYQLCPRVMKERKFWRIYFILVNSHVAPYEQRYTDDVKIKTAEKVEDTEVKEVSSGETSSKTADEITKPKSNNTEKKASEQDLDAFLLGDLEDGDDGPDDGDNGFEDDF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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