Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003392`

染色体: Chr04 坐标: 50465951-50467991 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003392`
名称	SmilChr04G003392
描述	uncharacterized SmilChr04G003392
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50465951 - 50467991 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020310`
GeneID	`131020310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020310`
原始查询	`LOC131020310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805025.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805025.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805025.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805025.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50467302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B114,B26,B58,B81,C47,C51,C7,D3
`Chr4:50467308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B46
`Chr4:50467311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr4:50467325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B46
`Chr4:50467373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B46
`Chr4:50467564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr4:50467578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B135,B46,B7,C62,D6,D9
`Chr4:50467732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B46,B78,C62,D6
`Chr4:50467735`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A1,A13,A18,B101,B103,B117,B118,B122,B124,B127,B131,B140,B20,B26,B27,B56,B96,C25,C27,C3,C37,C53,C67,C85
`Chr4:50467778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B7,B78,C62,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949045.1
GACTGCTTACATATAAACGGATTTGGTATGTTTATGAAATCCCGTGAATTACTCCATTCCTTGCTTGGTGTGATACCACCCGATTCCATGGAGAGAAATTCTAGGGTTCAATCCAACCCGATATCTGATCGATGATTAGGTTTGAGAGATCTCCACCACACTTTTTACGATTCATTAATTCAAACTTTTATTTGCGAAGAAAAGTTTCGAAGGTTCAATATATTTTTCATCGATATCAGTTCGCCGAATCGGTTAAGGAA...

XM_057949043.1
GACTGCTTACATATAAACGGATTTGGTATGTTTATGAAATCCCGTGAATTACTCCATTCCTTGCTTGGTGTGATACCACCCGATTCCATGGAGAGAAATTCTAGGGTTCAATCCAACCCGATATCTGATCGATGATTAGGTTTGAGAGATCTCCACCACACTTTTTACGATTCATTAATTCAAACTTTTATTTGCGAAGAAAAGTTTCGAAGGTTCAATATATTTTTCATCGATATCAGTTCGCCGAATCGGTTAAGGAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020310
ATGTTGATGGAGTTCTTCTTCCCTGTGTTCTCTGATGAACAACCTTATGTTATCTGTTTTGATTTGCGAAAAGAGCTGATTTTCAGCTTGGATACTTCTGCGGAGGTGAACAACCATCATATTGGATCGAACTACAACGTCTTGTGTGATATTCTACGATCTCTACTGGCTAATTTCTTAAAAACTAGCAATGAAGATTTAAGTTCGGCATCAGTTTCAAAATCATCTGTAAAAGTCGTTGATATCAGTTGGGCGTACGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805025.1
MLMEFFFPVFSDEQPYVICFDLRKELIFSLDTSAEVNNHHIGSNYNVLCDILRSLLANFLKTSNEDLSSASVSKSSVKVVDISWAYENNAVDAALYVMRHMETFEGDTSVEWNSGLMNATDHHIAILRMRYCSTIVMWEKNKYNEEVLKDASTTYGLELAENETRFDRLLIG

XP_057805026.1
MLMEFFFPVFSDEQPYVICFDLRKELIFSLDTSAEVNNHHIGSNYNVLCDILRSLLANFLKTSNEDLSSASVSKSSVKVVDISWAYENNAVDAALYVMRHMETFEGDTSVEWNSGLMNATDHHIAILRMRYCSTIVMWEKNKYNEEVLKDASTTYGLELAENETRFDRLLIG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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