当前解析结果
SmilChr04G003386| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003386 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003386 |
| 描述 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 50417948 - 50420024 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020314 |
|---|---|
| GeneID | 131020314 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020314 |
| 原始查询 | LOC131020314 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B-like |
| 产物 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B-like |
| Arabidopsis | AT3G18410 (AT3G18410)NADH dehydrogenase ubiquinone 1 beta subcomplex subunit 10-B-like protein (Complex I subunit NDUFS6) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821370] identity=77.7; qcov=0.981; evalue=7.14e-57; confidence=high |
| Rice | Os10g0576000- identity=63.8; qcov=0.552; evalue=7.74e-24; confidence=medium |
| GO | GO:0005747 (GO:0005747) |
| KEGG | smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF10249 (NDUFB10) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020314 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057805035.1 |
| 2 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057805035.1 |
| 3 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.80000 | XP_057805035.1 |
| 4 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.80000 | XP_057805035.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805035.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:50419777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C8 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805035.1PF10249
NDUFB10 25-81 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805035.1 |
Pfam | PF10249 |
NDUFB10 | Family | 25 | 81 | 4.9e-05 | 24.5 | NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。