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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003432`

染色体: Chr04 坐标: 50895559-50897121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003432`
名称	SmilChr04G003432
描述	presenilin-like protein At2g29900
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50895559 - 50897121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020326`
GeneID	`131020326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020326`
原始查询	`LOC131020326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	presenilin-like protein At2g29900
产物	presenilin-like protein At2g29900
Arabidopsis	`AT2G29900` (PS2) Presenilin-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817540] identity=62.1; qcov=1; evalue=2.65e-161; confidence=high
Rice	`Os01g0276400` - identity=46.7; qcov=0.974; evalue=9.81e-101; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016020 (membrane); GO:0016485 (protein processing); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01080 (Presenilin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805045.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805045.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057805045.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057805045.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50895891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B78,B79
`Chr4:50896276`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr4:50896276`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr4:50896326`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr4:50896326`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr4:50896597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805045.1

422 aa

211

422

Presenilin

PF01080 Presenilin 14-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805045.1`	Pfam	`PF01080`	Presenilin	Family	14	412	5.9e-120	401.5	Presenilin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949062.1
TTTTGGGATTGTAGTTATAAGTTTTAAAGTAAAATAAAGAAAACCCACTTATTTATCATGTTTGTCGTCGGAGATTAAATAAACTTGTAATGGAGAATCTCGAGACGAACATGAAGCAGCTCGATCTATTTATCTCGAGACGCAATTCACAAGAATGACGCGTTTGGGGCTCAATAAAATCTGCTAAAATTTCCGGAAATCGACGCTTCATCAGTCTTCACTCCCCCCCCAGAATCCAACAATTCTCGATCCAAAATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020326
ATGGAGCAAAATGCCAAACCCAAAACAATCCTCGAAACATGCGGCGAAGAAATCATCAGAATCATAACCCCAGTTTCAATATGTATGCTGTTGGTGGTAATTCTCGTCTCTATCCTTAACGAGGGTTCCTCCTTGGACGACAGCCTCTCATTTGCAACCATGGCCACCATGGCCTACAACGAGAGCAGCTCAGATTCTATATGGGACAAGCTCAAAGGCGCTCTCTTGAACTCTCTCGTATTCGTTGCCGTTGTGACGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805045.1
MEQNAKPKTILETCGEEIIRIITPVSICMLLVVILVSILNEGSSLDDSLSFATMATMAYNESSSDSIWDKLKGALLNSLVFVAVVTVATFLLVLLFYFRCTKFLKYYMGFSSLLVLGFMGGEIALFLIKVSSFPIDCVTFAVALYNFTVVGVMAVFMSKMAIFVTQAYLVVIGMLVAYWFTLLPEWTTWALLVAMSLYDLAAVLLPGGPLRLLVELAMSRDEDIPALVYEARPVISDAGLSDGVVRRRVWREGRGDFDED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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