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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003450`

染色体: Chr04 坐标: 50994832-50995971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003450`
名称	SmilChr04G003450
描述	uncharacterized SmilChr04G003450
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50994832 - 50995971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020344`
GeneID	`131020344`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020344`
原始查询	`LOC131020344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020344

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805078.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805078.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057805078.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805078.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50994889`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A7,B108,B4,B9
`Chr4:50994913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C74
`Chr4:50994913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:50994936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B101,B14,B16,B18,B3,B32,B42,B43,B50,B51,B64,B71,B84,B87,B99,C17,C43,C56,C66,C68,C78,D9
`Chr4:50994938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:50994939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B71,B96,C85
`Chr4:50994939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B96,C85
`Chr4:50994954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A11,B126,B130,B22,B28,B36,B48,B50,B53,B67,B7,B76,B82,B89,C16,C19,C31,C58,C6,C78,C86
`Chr4:50994956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:50994992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:50995044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:50995081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805078.1

281 aa

140

281

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 95-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805078.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	95	273	3e-15	57.3	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949095.1
GAAGCGGGGCTTCAAGGCGTTTATGAGATCGCCGCCGGGTACTTATGTGCAAGTGATCGAGACGGGTTGGGTGATGTCCCAGGATCTATTCCACAAGATTCTGAATCCTCGCGAGGAGTTGGACGGGGAGATATTAGACCTCTGGAATCTGAAGGCTCTCCGACGGCTCCGTCAAAATCAGCAGTGGATAGCTCGGGGAGAGACGAGGCTCGTTGCAGGCGTGACACGGGAGAGGACGCCGATAGCTTTTCTGGATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020344
ATGAGATCGCCGCCGGGTACTTATGTGCAAGTGATCGAGACGGGTTGGGTGATGTCCCAGGATCTATTCCACAAGATTCTGAATCCTCGCGAGGAGTTGGACGGGGAGATATTAGACCTCTGGAATCTGAAGGCTCTCCGACGGCTCCGTCAAAATCAGCAGTGGATAGCTCGGGGAGAGACGAGGCTCGTTGCAGGCGTGACACGGGAGAGGACGCCGATAGCTTTTCTGGATTTTTATGAGACCCTTTCCAGAGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805078.1
MRSPPGTYVQVIETGWVMSQDLFHKILNPREELDGEILDLWNLKALRRLRQNQQWIARGETRLVAGVTRERTPIAFLDFYETLSREFRSLHPDEPDWDNIQDRHGYEEWVVPEKLIAMFHGTDSGHTWPWLEAKEIFAMCNLDKSHWCTVVISISAWEVRVYDSLVHVEGTRKRRQNAMKPITRLMNKLLHTVGYYAHNPVRYVAAPDMPMNVVIMPIREQFIQEDSVSCGVFACAYLDRLICGAPTREQLRTPAQIQKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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