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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003454`

染色体: Chr04 坐标: 51021581-51025049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003454`
名称	SmilChr04G003454
描述	expansin-A23-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51021581 - 51025049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020348`
GeneID	`131020348`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020348`
原始查询	`LOC131020348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A23-like
产物	expansin-A23-like
Arabidopsis	`AT5G39280` (EXPA23) expansin A23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833924] identity=59; qcov=0.902; evalue=4.39e-98; confidence=high
Rice	`Os05g0477600` (OsEXP4) - identity=57.9; qcov=0.898; evalue=7.8e-92; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020348

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057805087.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057805087.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057805087.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805087.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51021596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C77
`Chr4:51021609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr4:51021700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr4:51021728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:51021740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:51021830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B49
`Chr4:51021904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr4:51022012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:51022016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C84
`Chr4:51022022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:51022067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B47
`Chr4:51022108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B46,C46,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805087.1

246 aa

123

246

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 59-142 aa PF01357 Expansin_C 153-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805087.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	59	142	2.5e-21	76.4	Lytic transglycolase
`XP_057805087.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	153	230	2.6e-24	85.9	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949104.1
ATGCATGTGTTATGCTTTAAAATGCAAATTGGATCTTCAAGTGTGGTTACTATCTTAGAAGGGCATGGATGGGATCTCGCTCGCGCAACCTTCTACGGCCCACCCGATGCCAATGATGGAATGGGAGGAGCATGTGGATACACAAACGTGTTCCAGCAAGGGTACGGCCAAGAGACGACGGCTCTAAGCACCGCCCTGTTCAACGACGGGGCCGCGTGCGGAGCATGCTTCGAGATCGTGTGCGTGAACGCTCCGCAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020348
ATGCATGTGTTATGCTTTAAAATGCAAATTGGATCTTCAAGTGTGGTTACTATCTTAGAAGGGCATGGATGGGATCTCGCTCGCGCAACCTTCTACGGCCCACCCGATGCCAATGATGGAATGGGAGGAGCATGTGGATACACAAACGTGTTCCAGCAAGGGTACGGCCAAGAGACGACGGCTCTAAGCACCGCCCTGTTCAACGACGGGGCCGCGTGCGGAGCATGCTTCGAGATCGTGTGCGTGAACGCTCCGCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805087.1
MHVLCFKMQIGSSSVVTILEGHGWDLARATFYGPPDANDGMGGACGYTNVFQQGYGQETTALSTALFNDGAACGACFEIVCVNAPQACKKGVIRVTATNFCPPDYSKTQDLWCNPPQKHFDLAQPMFLKIAEYRAGVVPVAYRRVKCGKRGGIKFVMGGNNYWTLVLVYNVGGVGDVKSMRVRSSGSDWTWMSRNWGQNWQLTQSLLGKTLSFEVTTSDGSVMQEIDVVPSSWGFGMTFEGKYNFH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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