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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003464`

染色体: Chr04 坐标: 51123401-51126909 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003464`
名称	SmilChr04G003464
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51123401 - 51126909 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020361`
GeneID	`131020361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020361`
原始查询	`LOC131020361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
Arabidopsis	`AT1G18650` (PDCB3) plasmodesmata callose-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838446] identity=53.4; qcov=0.723; evalue=1.41e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0756300` (OSJNBb0081K01.7) - identity=59.6; qcov=0.564; evalue=3.54e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057805110.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057805110.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805110.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805110.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51123511`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	92	A10,A14,A16,A18,A24,A5,A6,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B113,B119,B120,B121,B123,B124,B126,B129,B130,B131,B138,B140,B19,B21,B24,B25,B29,B33,B4,B42,B43,B44,B45,B48,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B6,B63,B7,B72,B73,B75,B85,B87,B89,B93,B96,B97,B99,C12,C15,C18,C19,C22,C26,C3,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C41,C44,C45,C46,C48,C5,C51,C53,C55,C56,C64,C66,C67,C71,C79,C8,C85,D2,D7
`Chr4:51123831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B22,B41,C55,D5
`Chr4:51123848`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B46,B70
`Chr4:51123848`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B46,B70
`Chr4:51123913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C68
`Chr4:51126678`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr4:51126678`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805110.1

202 aa

101

202

PF07983 X8 49-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805110.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	49	119	5.3e-22	79.0	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949127.1
ATTCTTTTTGCATTCAATCAATAAATTAAATTTAACATTTCTCAATATTAAATTGCCTATAGCGACCTTTTCCCAAATGAGCCTTAAAAAAGAGCGGTGGACACTCCACCACTCCACACACGTACTACCAAAATTCCATAGTTATTTTCCTTGGTATCTGATGGCTACTGCTTCTCTGCTTCTACTTCTGCTTCTCGCGGCGGCTGCTCGCTCCAGTGCGACGTGGTGCGTTTGCAAGCAGGGCGTGAGCGACGCCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020361
ATGAGCCTTAAAAAAGAGCGGTGGACACTCCACCACTCCACACACGTACTACCAAAATTCCATAGTTATTTTCCTTGGTATCTGATGGCTACTGCTTCTCTGCTTCTACTTCTGCTTCTCGCGGCGGCTGCTCGCTCCAGTGCGACGTGGTGCGTTTGCAAGCAGGGCGTGAGCGACGCCGTGTTGCAGAAAACTCTGGACTATGCGTGCGGATCCGGGGCGGACTGCAACCCGATCCGTCAAAGAGGGTCATGTTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805110.1
MSLKKERWTLHHSTHVLPKFHSYFPWYLMATASLLLLLLLAAAARSSATWCVCKQGVSDAVLQKTLDYACGSGADCNPIRQRGSCFSPNTVRAHCNYAVNSYFQRNRQAPLACDFTGTAAVVNSDPSTGGCAFPATASVTSTTAPTVTTPNGGSPLVTTPTTGASGGANNGLGFNNNLNVGIILVPKCILIYLLLILTIFGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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