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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001764`

染色体: Chr01 坐标: 32425165-32434625 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001764`
名称	SmilChr01G001764
描述	fatty acyl-CoA reductase 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32425165 - 32434625 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020422`
GeneID	`131020422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020422`
原始查询	`LOC131020422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fatty acyl-CoA reductase 3-like
产物	fatty acyl-CoA reductase 3-like
Arabidopsis	`AT4G33790` (CER4) Jojoba acyl CoA reductase-related male sterility protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829521] identity=52.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0298700` - identity=47.5; qcov=1.01; evalue=9.4e-161; confidence=high
GO	GO:0010345 (suberin biosynthetic process); GO:0035336 (long-chain fatty-acyl-CoA metabolic process); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0080019 (alcohol-forming very long-chain fatty acyl-CoA reductase activity)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03015 (Sterile); PF07993 (NAD_binding_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057805189.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057805189.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057805189.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057805189.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32425518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,C11,C2,C50,C70
`Chr1:32427696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:32432675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:32432698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:32433114`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr1:32433114`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr1:32433116`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr1:32433116`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr1:32434464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805189.1

485 aa

242

485

NAD_binding_4

Sterile

PF07993 NAD_binding_4 17-313 aa PF03015 Sterile 410-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805189.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	17	313	1.6e-74	251.1	Male sterility protein
`XP_057805189.1`	Pfam	`PF03015`	Sterile	Family	410	484	2.1e-15	57.3	Male sterility protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949206.1
CTTAGATTACTACTTCATTCTTGAACTAATTTTCGGTTGTTTGTGATGGAATTGCACAACATACTTCACTTTCTTGAAAACAAAAGCATTCTTCTCACTGGTGCCACTGGCTTTCTTGCAAAGGTTGTGATTGAGAAGATAATTAGGGTTCAACCAAATGTGAAGAAGCTATATCTTCTGCTGAGGGCCGCTGATTCTTTATCAGCTTTACATCGTTTTAATACGGAGGTGATGGAGAAGGACTTGTTTAAGGTAGTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020422
ATGGAATTGCACAACATACTTCACTTTCTTGAAAACAAAAGCATTCTTCTCACTGGTGCCACTGGCTTTCTTGCAAAGGTTGTGATTGAGAAGATAATTAGGGTTCAACCAAATGTGAAGAAGCTATATCTTCTGCTGAGGGCCGCTGATTCTTTATCAGCTTTACATCGTTTTAATACGGAGGTGATGGAGAAGGACTTGTTTAAGGTAGTGAGGAAGAAATATGGACCAAAACTGGATTCTCTTATCCAGGAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805189.1
MELHNILHFLENKSILLTGATGFLAKVVIEKIIRVQPNVKKLYLLLRAADSLSALHRFNTEVMEKDLFKVVRKKYGPKLDSLIQEKITVLSGDITLDCLGLQNSYLEELFGQVEIIINLAATTNFDERYDFALGVNTIGAANVLSFSKKCRKLRMFLHVSTAYVSGEKEGLILETPLKLGDVLGLDIDMENKIIQQNLQQLRADAATQNYTTSVMRDLGLQRARKYGWPNTYSFTKAMGEMVLGQFKENIPLIIIRPTII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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