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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003544`

染色体: Chr04 坐标: 51798806-51800329 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003544`
名称	SmilChr04G003544
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51798806 - 51800329 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020428`
GeneID	`131020428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020428`
原始查询	`LOC131020428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
产物	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
Arabidopsis	`AT1G54400` (AT1G54400) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841882] identity=48.4; qcov=0.495; evalue=3.52e-21; confidence=medium
Rice	`Os03g0157600` - identity=43.2; qcov=0.402; evalue=1.3e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805196.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057805196.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057805196.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805196.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51799085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:51799086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B12,B82
`Chr4:51800094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr4:51800171`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	142	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B122,B126,B129,B13,B131,B132,B135,B140,B15,B18,B2,B20,B22,B24,B26,B27,B3,B31,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B52,B53,B55,B60,B61,B62,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B76,B78,B8,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B97,B98,B99,C13,C14,C16,C19,C2,C20,C21,C24,C27,C29,C31,C32,C35,C36,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C63,C65,C67,C68,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805196.1

184 aa

184

HSP20

PF00011 HSP20 21-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805196.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	21	105	5.8e-06	27.0	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949213.1
CTTGCACCTCCAACAATGTTTTCGATCGCAAACCATACCAAATATAAATCTCACTATATATGTATATATATCAATATAAATTGTTTGAAGGGAGACAACTAATCATTCATCACCAAATCAACATCTTCAAAATACAAAGAGCTCTTTTGAATATATATGGCGGCAAAAGCTGTTGATCGGGAAATTGTGTATGAGGAGTTCGAACCTTTTTGCAAATGGCAACGCAAGGAGGATCGCGATGTTCTTGAAGTCCACCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020428
ATGGCGGCAAAAGCTGTTGATCGGGAAATTGTGTATGAGGAGTTCGAACCTTTTTGCAAATGGCAACGCAAGGAGGATCGCGATGTTCTTGAAGTCCACCTCCAAGATTTCAAAAAGGAACAGCTGAAAGTGCAAATCAGCAATCATGGGGTGCTGAAGATTTCTGGAGAGCGCCAAATAGATGCTTCCAAACACATGAAATTTTACAAAGAAGTGGCTGCGCCCAACACCAAATACGACACGCATGCAATCCATGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805196.1
MAAKAVDREIVYEEFEPFCKWQRKEDRDVLEVHLQDFKKEQLKVQISNHGVLKISGERQIDASKHMKFYKEVAAPNTKYDTHAIHAKFVNSNLIITLPKTKLPSSPEPSKTDQPSKPSGGAQEKAPLPPLSAAAVQCQLQSCRQRQLMGSKLAKMAASLAATVVAVVVLAAYVHFMYKSTVDHI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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