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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003545`

染色体: Chr04 坐标: 51806472-51810664 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003545`
名称	SmilChr04G003545
描述	binding partner of ACD11 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51806472 - 51810664 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020431`
GeneID	`131020431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020431`
原始查询	`LOC131020431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	binding partner of ACD11 1
产物	binding partner of ACD11 1
Arabidopsis	`AT5G32450` (AT5G32450) RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833204] identity=69.3; qcov=0.989; evalue=8.17e-132; confidence=high
Rice	`Os03g0748900` (OSJNBa0069E14.5) - identity=62.7; qcov=0.985; evalue=3.24e-115; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805198.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805198.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805198.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805198.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51806838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:51808757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C58
`Chr4:51809798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D4
`Chr4:51810380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805198.1

269 aa

134

269

RRM_1

PF00076 RRM_1 10-59 aa

XP_057805199.1

268 aa

134

268

RRM_1

PF00076 RRM_1 10-59 aa

XP_057805200.1

268 aa

134

268

RRM_1

PF00076 RRM_1 9-58 aa

XP_057805201.1

267 aa

134

267

RRM_1

PF00076 RRM_1 9-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805198.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	59	8e-06	26.3	RNA recognition motif
`XP_057805199.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	59	8e-06	26.4	RNA recognition motif
`XP_057805200.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	58	8e-06	26.4	RNA recognition motif
`XP_057805201.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	58	7.9e-06	26.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949216.1
GAGGTATATATCATCAAAAAGTCTTCAATTTTGAACCTCAACATTCTTCTGCACCTTTATATTCTTTTCTTCCTTTCTATCTCTCTCTCTCTCCCGTCTTCTTAGAGTCGCTTCCGTATTCACATGCAAATTTACACTCAATAATACACAGAGTTGGCGTGCAAGTACGGACTGTGAGCGCACGCAAATCTGTTGAGCGATTCTCGAATATATTTGAAGAAGATCTGATAAAATTTAACCGACAATGCCACAGACAAGAA...

XM_057949215.1
ATATCATCAAAAAGTCTTCAATTTTGAACCTCAACATTCTTCTGCACCTTTATATTCTTTTCTTCCTTTCTATCTCTCTCTCTCTCCCGTCTTCTTAGAGTCGCTTCCGTATTCACATGCAAATTTACACTCAATAATACACAGAGTTGGCGTGCAAGTACGGACTGTGAGCGCACGCAAATCTGTTGAGCGATTCTCGAATATATTTGAAGAAGATCTGATAAAATTTAACCGACAATGCCACAGACAAGAACAGTTCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020431
ATGCCACAGACAAGAACAGTTCAAGTTAATCAGGTTTCAGATCTAGCTACCGAGAGAGAAATTCACGAGTTCTTTTCTTTCGCCGGTGAAATTGAGCACATTGAGATCCGCAGAGAGACTCCGCAGTTCAAAACTGCGTTTGTCACTTTTAAAGATCCAAAGGCGCTTGACATCGCCCGTTTTTTATCGGGTGCAACAATAGTGGACCAGGTTGTTAGCATCACACCTTCAGAAAATTATGTACCTCAACAAGAGACTTG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805198.1
MPQTRTVQVNQVSDLATEREIHEFFSFAGEIEHIEIRRETPQFKTAFVTFKDPKALDIARFLSGATIVDQVVSITPSENYVPQQETWEVQTSENTASISQGNVSPVAEQGNVSPNNERVYVSKAQDVVSSMIAKGSAIGQDAVNKAKAFDEKHKLTASASARVISFDQRVGLTEKFTVGISVVNEKVKSVDQKFQVSDKTMSALMAAERKLNDTGTAVKSSRYVTAGTSWLNGAFTKVAKVGQVAGSKTREKWNMALSNL...

XP_057805199.1
MPQTRTVQVNQVSDLATEREIHEFFSFAGEIEHIEIRRETPQFKTAFVTFKDPKALDIARFLSGATIVDQVVSITPSENYVPQQETWEVQTSENTASISQGNVSPVAEGNVSPNNERVYVSKAQDVVSSMIAKGSAIGQDAVNKAKAFDEKHKLTASASARVISFDQRVGLTEKFTVGISVVNEKVKSVDQKFQVSDKTMSALMAAERKLNDTGTAVKSSRYVTAGTSWLNGAFTKVAKVGQVAGSKTREKWNMALSNLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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