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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003552`

染色体: Chr04 坐标: 51871439-51874971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003552`
名称	SmilChr04G003552
描述	uncharacterized SmilChr04G003552
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51871439 - 51874971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020435`
GeneID	`131020435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020435`
原始查询	`LOC131020435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558]; symbol=AT3G44330; hit=AT3G44330; species=arabidopsis; confidence=low
产物	M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558]; symbol=AT3G44330; hit=AT3G44330; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G44330` (AT3G44330) M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558] identity=79; qcov=0.325; evalue=9.44e-14; confidence=low
Rice	`Os08g0102100` - identity=79; qcov=0.325; evalue=1.6e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805206.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805211.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057805211.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805206.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51871842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B33,B74,B77,C48
`Chr4:51871842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B74,B77,C48
`Chr4:51871860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B112,B118,B39,B62,B87,B99,C27,C3,C61,C77,D9
`Chr4:51871865`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:51871911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,D6
`Chr4:51871962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B45,B89,C10,C72
`Chr4:51871962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B89,C10,C72
`Chr4:51871975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B68,B77,D11
`Chr4:51871977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A23,B100,B13,B33,B68,B7,B77,C11,C36,C69,D11
`Chr4:51871980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	127	A1,A11,A14,A15,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,B1,B10,B101,B103,B108,B110,B111,B113,B114,B115,B118,B125,B126,B13,B130,B131,B132,B135,B138,B18,B2,B22,B23,B28,B29,B31,B32,B34,B35,B36,B42,B43,B45,B47,B49,B50,B51,B52,B54,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B66,B69,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B8,B80,B81,B83,B87,B88,B89,B90,B91,B92,C1,C14,C15,C19,C20,C23,C24,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C36,C39,C40,C42,C43,C44,C47,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C56,C59,C6,C61,C65,C68,C7,C72,C73,C76,C79,C80,C84,C86,C9,D10,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr4:51871986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B45,B89,B99,C10
`Chr4:51871998`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B11,B134,B34,B5,B65,B86,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

15 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100696.1
CCAAAGTGCCATACTTTTGGCGGACCGAGGGAGTATTATTTTCTCACTCATTCATCGGTCTCTCCACTCATCCATCGGTCTCTTTGAAAAACTAAAAATCATATCTCAAAAACTAAAAATCAAATCTTGCTACGATCGTGCCTTCATCGCCGGTGTCTCCACTGCCGCTGCCAACGATCGTGCCTTCATCGCCGGGCGCATTCGTCACCCGAAGTCTCACCGTGGGAGACAACTGACAGCGGCGCTCGGCTGCCCAAGCC...

XR_009100693.1
CCAAAGTGCCATACTTTTGGCGGACCGAGGGAGTATTATTTTCTCACTCATTCATCGGTCTCTCCACTCATCCATCGGTCTCTTTGAAAAACTAAAAATCATATCTCAAAAACTAAAAATCAAATCTTGCTACGATCGTGCCTTCATCGCCGGTGTCTCCACTGCCGCTGCCAACGATCGTGCCTTCATCGCCGGGCGCATTCGTCACCCGAAGTCTCACCGTGGGAGACAACTGACAGCGGCGCTCGGCTGCCCAAGCC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131020435
ATGCAAGCCCTCCCCCGTCGCCGATGGCCCGTTCCGTCTCACTCATCAGTTCTCCCTACGAATCAGATATTGCTACGCTATCTCTCACTGTGCCATGGATTCTCCACCGCCGACTCCTTCTCTCAACATTGCCGCCGCCAACGACCGGTAATGGCACCAGCCTCCGAGGGATTCACAAAACATTCCAGGACGCCCACATCTCCTCATCGGCGCCGCCGATCCCTTCCAACGCTGGTTTATCGCCGCCTCCTCTGCCATGG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057805206.1
MQALPRRRWPVPSHSSVLPTNQILLRYLSLCHGFSTADSFSQHCRRQRPVMAPASEGFTKHSRTPTSPHRRRRSLPTLVYRRLLCHGILQDKRDLGVSSQYNIRDSFVAVIVYDVEPRTVIALHALSGKALLSCFYCFICSSCLKFSVAWEHEQFSRLRATAATLSELSVAPDFLESAGGLSDSRL

XP_057805207.1
MQALPRRRWPVPSHSSVLPTNQILLRYLSLCHGFSTADSFSQHCRRQRPVMAPASEGFTKHSRTPTSPHRRRRSLPTLVYRRLLCHGILQDKRDLGVSSQYNIRDSFVAVIVYDVEPRTVIALHALSGFICSSCLKFSVAWEHEQFSRLRATAATLSELSVAPDFLESAGGLSDSRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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