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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003551`

染色体: Chr04 坐标: 51863397-51866745 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003551`
名称	SmilChr04G003551
描述	probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51863397 - 51866745 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020436`
GeneID	`131020436`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020436`
原始查询	`LOC131020436`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11
产物	probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020436

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805212.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805213.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805213.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805212.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805212.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51863687`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr4:51863687`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr4:51863690`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr4:51863690`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr4:51863794`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B29,C62
`Chr4:51863794`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B29,C62
`Chr4:51865896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B39,B64,C20
`Chr4:51865912`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A15,A18,A19,A20,B1,B10,B102,B104,B115,B117,B134,B14,B35,B38,B39,B4,B44,B46,B5,B51,B55,B56,B62,B63,B67,B76,B79,B81,B84,B90,B96,B98,C22,C26,C28,C42,C56,C59,C6,C72,C76,C78,C79,C8,C84,D2
`Chr4:51865918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B16,B60,C69
`Chr4:51865918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B60,C69
`Chr4:51865920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr4:51865924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100703.1
TTCCTTTCTCTGCGTCGACCACCACCTCCATTTCCCCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCTCTGCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCAGCCGCGATCTGCCACCTTTCGCCGCCCGCTAGAGATCTGCTCTTCCACCTTCTCCGATGCCACCTCCTTTTTCCCCTCCCTCCCCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCATTCCACCGCGATTCGCAGCGATGAGATTTGCCCCTTCCACAGTTCCACCTTCTGATTCGA...

XR_009100704.1
TTCCTTTCTCTGCGTCGACCACCACCTCCATTTCCCCGATGCCACCTCCATTTTCCCCTCCCTCTGCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCAGCCGCGATCTGCCACCTTTCGCCGCCCGCTAGAGATCTGCTCTTCCACCTTCTCCGATGCCACCTCCTTTTTCCCCTCCCTCCCCCGGCGATTCGACTCACCGGCCGCATTCCACCGCGATTCGCAGCGATGAGATTTGCCCCTTCCACAGTTCCACCTTCTGATTCGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020436
ATGGCCGCCGATCTGCCCCTCCCACCACCAGAAAACCAGAAATCGATCTGCCACCTCCCTTCCCCCTATGGTGCCTGGTCCAGAACCGCCGCTCGCCAGCCGCTGTGTTGCAGTCGCCCACTCCTATTCTCACTTCAACTGACTGAAGCAAGAGAAATTCGAGCTCAGGCTTCTGAACACAGAGAAAACCACTCTTTTGAAGACTTTCCCAAAGATATTAAAAGGAAGATAATTGCTTCATACCGTGAGCTAGAGCCTAG...

LOC131020436
ATGAGATTTGCCCCTTCCACAGTTCCACCTTCTGATTCGAGGTTCGGCGAAGGGAGCCTCTTTGCGATTTCCGGTGCGAATCGCCGCGCCCCTAGATCCCCAAATCCTCACCGTCTCTTTGCGATTTTCGGCGACCACAACAGCCATGGCCGCCGATCTGCCCCTCCCACCACCAGAAAACCAGAAATCGATCTGCCACCTCCCTTCCCCCTATGGTGCCTGGTCCAGAACCGCCGCTCGCCAGCCGCTGTGTTGCAGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805212.1
MRFAPSTVPPSDSRFGEGSLFAISGANRRAPRSPNPHRLFAIFGDHNSHGRRSAPPTTRKPEIDLPPPFPLWCLVQNRRSPAAVLQSPTPILTSTIGLKQEKFELRLLNTEKTTLLKTFPKILKGR

XP_057805213.1
MAADLPLPPPENQKSICHLPSPYGAWSRTAARQPLCCSRPLLFSLQLTEAREIRAQASEHRENHSFEDFPKDIKRKIIASYRELEPRRSRVKELEKIYMDMAMQKELQEKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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