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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001709`

染色体: Chr01 坐标: 31559208-31560709 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001709`
名称	SmilChr01G001709
描述	agmatine coumaroyltransferase-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31559208 - 31560709 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020451`
GeneID	`131020451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020451`
原始查询	`LOC131020451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agmatine coumaroyltransferase-2-like
产物	agmatine coumaroyltransferase-2-like
Arabidopsis	`AT5G48930` (HCT) hydroxycinnamoyl-CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyl transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834951] identity=32; qcov=1.03; evalue=8.42e-68; confidence=low
Rice	`Os04g0664600` (AHT1) - identity=47.9; qcov=1.05; evalue=1.76e-153; confidence=high
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805241.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805241.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805241.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805241.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31559291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:31559304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B56,B96
`Chr1:31559354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:31559379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:31559457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:31559473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:31559483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:31559517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:31559524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,D10
`Chr1:31559532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B86,B99,C15
`Chr1:31559534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B114,B31,B81,C7
`Chr1:31559572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805241.1

430 aa

215

430

Transferase

PF02458 Transferase 1-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805241.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	425	1.3e-74	252.1	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949258.1
CTCAAATTAAACCAAATCACAACCTTTCTCATATTGTCCAAATTAGAATACATTCCAAAAAATGAAGGTGAAGATAGAAAACACTAGGCTCGTTAAGCCTTTGTATCAAGGCACCACACCTCGCACATCGGATTATGTGCCCTTATCAGTCTTTGACAAGGTCACGTATAACCAACATATAGCCGTGATATACGCTTACAACCCTCCCACCCAATCGAATGCGGCCATCGAGTTAGGGCTCCGAAAGGCGTTGGCGGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020451
ATGAAGGTGAAGATAGAAAACACTAGGCTCGTTAAGCCTTTGTATCAAGGCACCACACCTCGCACATCGGATTATGTGCCCTTATCAGTCTTTGACAAGGTCACGTATAACCAACATATAGCCGTGATATACGCTTACAACCCTCCCACCCAATCGAATGCGGCCATCGAGTTAGGGCTCCGAAAGGCGTTGGCGGCCTACCGCGCGTGGGCGGGGAGGTTCGGTGAAGATAGTGGCGGGAACCCCATCATTCTTCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805241.1
MKVKIENTRLVKPLYQGTTPRTSDYVPLSVFDKVTYNQHIAVIYAYNPPTQSNAAIELGLRKALAAYRAWAGRFGEDSGGNPIILLNDGGIRFVEASVDYALDRTMLLKPSPFLLSLHPDLKGVAELVQVQLTRFSCGSMVVGFTAHHHVADGHSSSNFLVAWGQATRGLRISPLPFYDRMIFPPRNPPKIEFQHCGAEYIPRNFKKTYPMIDYNIDDVVIHKVHYNAEFISKLKAKASTNTKRFTTIEALLAHLWRAIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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