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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003577`

染色体: Chr04 坐标: 52183946-52187752 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003577`
名称	SmilChr04G003577
描述	uncharacterized SmilChr04G003577
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52183946 - 52187752 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020455`
GeneID	`131020455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020455`
原始查询	`LOC131020455`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008084]; symbol=AT3G52905; hit=AT3G52905; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008084]; symbol=AT3G52905; hit=AT3G52905; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G52905` (AT3G52905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008084] identity=50; qcov=0.982; evalue=6.75e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0764700` - identity=48.8; qcov=0.994; evalue=1.96e-45; confidence=medium
GO	GO:0000967 (rRNA 5'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF03652 (RuvX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805244.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057805242.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805244.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057805244.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057805242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52185202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805242.1

183 aa

183

RuvX

PF03652 RuvX 23-158 aa

XP_057805243.1

183 aa

183

RuvX

PF03652 RuvX 23-158 aa

XP_057805244.1

165 aa

165

RuvX

PF03652 RuvX 44-140 aa

XP_057805245.1

165 aa

165

RuvX

PF03652 RuvX 44-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805242.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	23	158	2.3e-25	90.2	Holliday junction resolvase
`XP_057805243.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	23	158	2.3e-25	90.2	Holliday junction resolvase
`XP_057805244.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	44	140	2e-14	54.8	Holliday junction resolvase
`XP_057805245.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	44	140	2e-14	54.8	Holliday junction resolvase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949262.1
CCCAAATAATATCAGAATGAGTTATAAAACAACAAAAAAGTTTGGTAATACTAGAAACAAACATGTCTCATCCCAAGCAAACATTAAAAGCATGGCGGCCGTTCGTCACTCCCGTCCGAAAAGGAGCCGTGAAGCTGCGAATCTTCGCCTCCTGTTCCTTTTTCAAGACCCATCTCCTTCGTTGCTTCCGTCCCAGTTAATCAGATAATACAAAACACTCATGTCTTCTTCTTCTTTAATTGTTTCAGAGAGTGTCTTCT...

XM_057949260.1
CCCAAATAATATCAGAATGAGTTATAAAACAACAAAAAAGTTTGGTAATACTAGAAACAAACATGTCTCATCCCAAGCAAACATTAAAAGCATGGCGGCCGTTCGTCACTCCCGTCCGAAAAGGAGCCGTGAAGCTGCGAATCTTCGCCTCCTGTTCCTTTTTCAAGACCCATCTCCTTCGTTGCTTCCGTCCCAGTTAATCAGATAATACAAAACACTCATGTCTTCTTCTTCTTTAATTGTTTCAGAGAGTGTCTTCT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020455
ATGAAGTACTTGAAGCCATTGAAATTGTATCAAGAATTGTTAAAGGCAAGTGAGGTCAAAAGAGGCCGTTTGCTTGGCTTGGATGTAGGTGATAATGTCCTTGTACGTAAAAGAACAAATATTGACCTGATATCTTCTGATTTCCAGACTTTGATCTCTGAACTTTCCCTGGAAGGCTTTGTCATTGGCTATCCTTTCGACAGGCAGAAGAGCAGCCCAGATGCAGTGCAAATGAAGCTTTTTATTGATGATCTCAATAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805242.1
MKYLKPLKLYQELLKASEVKRGRLLGLDVGDKYVGLSVSDDNNKTASPLSVLVRKRTNIDLISSDFQTLISELSLEGFVIGYPFDRQKSSPDAVQMKLFIDDLNKTGKFEDLKYTFWDECYTSKNVEFLLKPLTLHPVQLKTIMDKFAAVGILQGYLDFASRSRGLNQETENVLDEKLSDNLD

XP_057805243.1
MKYLKPLKLYQELLKASEVKRGRLLGLDVGDKYVGLSVSDDNNKTASPLSVLVRKRTNIDLISSDFQTLISELSLEGFVIGYPFDRQKSSPDAVQMKLFIDDLNKTGKFEDLKYTFWDECYTSKNVEFLLKPLTLHPVQLKTIMDKFAAVGILQGYLDFASRSRGLNQETENVLDEKLSDNLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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