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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001742`

染色体: Chr01 坐标: 32106378-32108368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001742`
名称	SmilChr01G001742
描述	arogenate dehydratase 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32106378 - 32108368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020457`
GeneID	`131020457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020457`
原始查询	`LOC131020457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arogenate dehydratase 3-like
产物	arogenate dehydratase 3-like
Arabidopsis	`AT1G08250` (ADT6) arogenate dehydratase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837345] identity=80.3; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0406600` - identity=76.8; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004664 (prephenate dehydratase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009094 (L-phenylalanine biosynthetic process); GO:0009507 (chloroplast); GO:0047769 (arogenate dehydratase activity)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00800 (PDT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805256.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057805256.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805256.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805256.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32106946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B28,B7
`Chr1:32106992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32106997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32107033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32107081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32107093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32107152`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B130,C51
`Chr1:32107152`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B130,C51
`Chr1:32107179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D7
`Chr1:32107185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B125,C41
`Chr1:32107194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B11,B45,B74,B96
`Chr1:32107196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B98,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805256.1

423 aa

212

423

PDT

PF00800 PDT 127-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805256.1`	Pfam	`PF00800`	PDT	Family	127	304	5.3e-59	199.8	Prephenate dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949273.1
ATGTTATCATCATTTGATGGATATCCAATTACATTCATAAACGAAGAAAACGATCATAATCTACGTAACGTGAAATATTTTGAACAAGTTCAACGTGAGAATATTTAATAAATTTCATATTATCTATTATAATAGTATTATTTTTTTTAAAAATGAAAGAGTAAAAGGGAAATGGAGAAATTGGACGGGGGTAGGTGTGGGATTGACCAAACCAATGTTGAGACAGACTCGCACAATATATAAACCCCTTTTCCCCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020457
ATGCGATCCCTTAGTTCCCCCGCCGGCCTAGACCTCAAATCCCTAATCCGGACGCCGCGGGTCGGGCCGGCTCGTCGGGCCATCCAGTGCAACGTCAATTCCAGCACGAATCAGGCTACCGGTATCAGCTTCGGGTCGGGCCAGGTCGGCCGGGCCCGATACGAGTGGCAGAGCGCGTGCGCCATACTCGCCAGCAAAGTGGAATCGCAGCAGCAGGACACCCAGAAGAGCGGCGCCGACGGCGTCTCCGTCGTCAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805256.1
MRSLSSPAGLDLKSLIRTPRVGPARRAIQCNVNSSTNQATGISFGSGQVGRARYEWQSACAILASKVESQQQDTQKSGADGVSVVNGHPTLDLVPVKDQSSSPAPLRKPLSIADFSPAPMHGAQLRVAYQGVPGAYSEAAAGKAYPNCEAIPCDQFEVAFQAVELWLADRAVLPVENSLGGSIHRNYDLLLRHRLHIVGEVQLPVHHCLLALPGVRKEYLTRVISHPQALSQCEHTLTKLGLNVVREAVDDTAGAAEYIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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