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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003579`

染色体: Chr04 坐标: 52212749-52216297 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003579`
名称	SmilChr04G003579
描述	uncharacterized SmilChr04G003579
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52212749 - 52216297 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020460`
GeneID	`131020460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020460`
原始查询	`LOC131020460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0568700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0568700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G06440` (AT5G06440) polyketide cyclase/dehydrase/lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830532] identity=44.8; qcov=0.931; evalue=5.24e-128; confidence=medium
Rice	`Os11g0568700` - identity=45; qcov=0.958; evalue=2.63e-131; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057805257.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805257.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805257.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805257.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52213750`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D6
`Chr4:52213750`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D6
`Chr4:52213895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:52214139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:52214160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52214792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D4
`Chr4:52215029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B6,C63
`Chr4:52215080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,C21,C40,C81
`Chr4:52215300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C40
`Chr4:52215663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:52216095`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr4:52216095`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949274.1
ACATCAGCACAAATGCTTGAACAAAGTCGGAATGTCTTAATTATGCAATTATAACTGCAGCTCCGAAGTGGTTAGCCATGAAGAATTTATGGGACTAAACAATTAGTGCATTTATAACTAAGTGGGAGGGCTTGATTAATGATGAGGATTTGGCACCAGTAATATCTCCTTTGTATAATCACATCCACACACGCATTGCAGATGAGATGGAGTTTACCTCAATATTTTTATATGCCTCGTTTTGTTTTATTTCTTGGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020460
ATGGATGGGAAAGGAACTATCTCAGATTATAGAAGCAAGATGGACACAACACTATCCTCACCCGACTTGACAAACCACGAAAGGCTTCAAACTCTAGTGAGGAATCAAATCCTGCAATCTTCGGATCTTCAGTTTGAAGGATGCGTTGAGAATGTGGTCGAGAGGAGGAGCAACGAGGTGTCCAATTTTCTTGGTATGTTGAGGAGCACTGCCTTGGTGAACGATGCTGACAGATCAAATACTGCCTGGAAAGTGAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805257.1
MDGKGTISDYRSKMDTTLSSPDLTNHERLQTLVRNQILQSSDLQFEGCVENVVERRSNEVSNFLGMLRSTALVNDADRSNTAWKVKQDTEEFRVMYREGPEGTPFHTLLVEGYVDGPLDVCLCISWETGLYNKWWPQTAIPTFKVISSRCLQRVGAGEQISLVRMKVSWPLSSREAVIHYFVFEYFQEDLMVVVINSISDSETIDRHSHGFTRDGIPNAEEVVRIDMVGGFALQKVTAERSYFRTIANMDIKLDFVPPSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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