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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003582`

染色体: Chr04 坐标: 52240388-52242144 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003582`
名称	SmilChr04G003582
描述	protein WVD2-like 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52240388 - 52242144 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020463`
GeneID	`131020463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020463`
原始查询	`LOC131020463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WVD2-like 4
产物	protein WVD2-like 4
Arabidopsis	`AT2G35880` (AT2G35880) TPX2 (targeting protein for Xklp2) protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818161] identity=40.4; qcov=0.939; evalue=2.04e-43; confidence=medium
Rice	`Os11g0571900` - identity=64.1; qcov=0.399; evalue=4.66e-41; confidence=low
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF06886 (TPX2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057805261.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057805261.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805261.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805261.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52240925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B76,C16
`Chr4:52241096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B118,B124,B31,C58
`Chr4:52241256`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A14,A16,A19,A3,B100,B125,B41,C11,C21,C69
`Chr4:52241342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:52241349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B88
`Chr4:52241684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:52241878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:52241907`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,A18,A23,A3,B107,B112,B119,B130,B132,B25,B34,B46,B48,B51,B57,B60,B63,B64,B84,C12,C29,C41,C50,C53,C58,C72,C8,C87,C9,D10
`Chr4:52241910`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A1,A18,A23,A3,B107,B112,B119,B130,B132,B25,B34,B46,B48,B51,B57,B60,B63,B64,B84,C12,C29,C41,C50,C53,C58,C72,C8,C87,C9,D10
`Chr4:52241927`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,B51,B67,B88,C46,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805261.1

293 aa

146

293

TPX2

PF06886 TPX2 160-234 aa

XP_057805262.1

293 aa

146

293

TPX2

PF06886 TPX2 160-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805261.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	160	234	2.5e-24	85.7	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain
`XP_057805262.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	160	234	2.5e-24	85.7	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949279.1
GAATAGTTAACTGAATGGCAGTTTTGTCCTTATGAAACTACTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAACACTGTAACGGTTCCCCGATTCATACAGATGAACCATTCCAATTCTTAAATTTGCCATTTCCGACAACAGAACACAACCTTAGCAGTTCCAAATCCATCCACCAAAAACCGCAAAACAGGTAATAATATTTCCCTCATCTCATCCCTACATGCTTACAATGAAAACATGTTGAAGAAAATCTGTTTCTCCTCAGCTCA...

XM_057949278.1
GAATAGTTAACTGAATGGCAGTTTTGTCCTTATGAAACTACTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAACACTGTAACGGTTCCCCGATTCATACAGATGAACCATTCCAATTCTTAAATTTGCCATTTCCGACAACAGAACACAACCTTAGCAGTTCCAAATCCATCCACCAAAAACCGCAAAACAGCTCATCCTTAATTTCAAAGGATAATAGTCTGAATTCGTTGTCCATAAATCTATAAACTCGATCGGTTGTGTGAGAATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020463
ATGGAGGGCGTTGTAGCGGAAGACGACAAGGAAGTGAGGATGGAGAAATGCAGCAGCAACACAGTCGTCACAGACACGAGCCAAGTGATGAGCAGTGAGAGTAGAAAGCGAATTGAGAAAAAGGGCGTCACAAATTCAGAATCATCGAAGATGAAAACGAAGAAGAAGGAAGCAAGAATATCGGAGGTGTTGGGGCGCAGCCTGAGCCAGAGCCTGTCGTTTCCGGGCAGGGGGCGGCAGTCGGACATAATGAAGAGGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805261.1
MEGVVAEDDKEVRMEKCSSNTVVTDTSQVMSSESRKRIEKKGVTNSESSKMKTKKKEARISEVLGRSLSQSLSFPGRGRQSDIMKRSIEIYPTDSDVKQFQKNSSKVESRVSQRRSNPVSLGKKPFPGSRPLSVSVSASDALVDKEDDARSTTSSNLRLFSFRSEERAQRRKEFFSKIEHKVQAKEVEKNDMQAKSKENQEAEIKQLRKSLTFRATPMPSFYKEPPPKVELKKIPTTRAKSPKLGRQKGGSGSESGSPRR...

XP_057805262.1
MEGVVAEDDKEVRMEKCSSNTVVTDTSQVMSSESRKRIEKKGVTNSESSKMKTKKKEARISEVLGRSLSQSLSFPGRGRQSDIMKRSIEIYPTDSDVKQFQKNSSKVESRVSQRRSNPVSLGKKPFPGSRPLSVSVSASDALVDKEDDARSTTSSNLRLFSFRSEERAQRRKEFFSKIEHKVQAKEVEKNDMQAKSKENQEAEIKQLRKSLTFRATPMPSFYKEPPPKVELKKIPTTRAKSPKLGRQKGGSGSESGSPRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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