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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003597`

染色体: Chr04 坐标: 52407246-52410129 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003597`
名称	SmilChr04G003597
描述	protein SMAX1-LIKE 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52407246 - 52410129 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020473`
GeneID	`131020473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020473`
原始查询	`LOC131020473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMAX1-LIKE 3-like
产物	protein SMAX1-LIKE 3-like
Arabidopsis	`AT3G52490` (AT3G52490) Double Clp-N motif-containing P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824414] identity=52.1; qcov=0.669; evalue=3.33e-144; confidence=high
Rice	`Os04g0298700` (OSJNBa0035B13.5) - identity=33.3; qcov=0.887; evalue=4.19e-69; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02861 (Clp_N); PF23569 (NBD_SMAX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805278.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057805278.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805278.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805278.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52407654`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:52407654`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:52407656`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:52407656`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:52407689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B122
`Chr4:52407691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:52407749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B127,B37,B5,C62
`Chr4:52407809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:52407829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B140
`Chr4:52408092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:52408102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B113,B133,C42
`Chr4:52408219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C15,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805278.1

708 aa

354

708

Clp_N

NBD_SMAX1

PF02861 Clp_N 13-109 aa PF23569 NBD_SMAX1 188-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805278.1`	Pfam	`PF02861`	Clp_N	Family	13	109	4.5e-11	43.8	Clp repeat (R) N-terminal domain
`XP_057805278.1`	Pfam	`PF23569`	NBD_SMAX1	Domain	188	361	7.5e-57	193.1	SMAX1 nucleotide binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949295.1
TAACATACTTTACCTATATTTTATATTCAAACATTTTCTTTCACCTCATCAACAAGAAAAGAATTCTCTTTCTCTTTTATCTATATTTAACTGTCTTCATCAAACACAGTCCACAATCCCAGTCCCCAACAACAAACACCAAACTTTTCCCATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCCCATTGTCATGCAACAAAAACCAAGTTTCCCGTAGGTTTTTCCGATCAAATTAACAATCCACACATAGCAAATTAGAGTAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020473
ATGAGAGCGAGCGGGAACTGCGCGGTGCAGCAGGGTCTGACGGCGGAGGCGGGCGGGGTGGTGAAGCAGGCGCTGGTGCTGGCGAAGCGGCGCGGCCATGCACAGGTGACGCCGCTCCACGTGGCGAACACGATGCTGGCGGCGGCGGGCGGCATCTTCCGGGTGGCGTGCCTGGACTCGCACTCCCACCCCCTCCAGTGCAAGGCCCTGGAGCTGTGCTTCAACGTGGCCCTGAACCGCCTCCCCGCGGCCTCCACCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805278.1
MRASGNCAVQQGLTAEAGGVVKQALVLAKRRGHAQVTPLHVANTMLAAAGGIFRVACLDSHSHPLQCKALELCFNVALNRLPAASTPHHPSISNALVAAFKRAQAHQRRGSTDSQQQPLLAVKIELEQLIISILDDPSVSRVMREAGFSSTQVKINVEKAISLQLGRCSPPPPTSKQTLLSSSSPPGNEDLDAIIDTLLMRKSVALVGESTSNLEATVKGVMDRVERGEVPESLREVKFISIPPFCNLRRDQVELKIREL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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