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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003602`

染色体: Chr04 坐标: 52453474-52460251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003602`
名称	SmilChr04G003602
描述	exocyst complex component EXO70A1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52453474 - 52460251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020478`
GeneID	`131020478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020478`
原始查询	`LOC131020478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exocyst complex component EXO70A1-like
产物	exocyst complex component EXO70A1-like
Arabidopsis	`AT5G52340` (EXO70A2) exocyst subunit exo70 family protein A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835310] identity=71.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0157400` (OsEXO70A3) - identity=67.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000145 (exocyst); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0006887 (exocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF03081 (Exo70_C); PF20669 (Exo70_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805283.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057805283.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057805283.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805283.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057805283.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52453791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:52453809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:52454211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C22,C83,C86
`Chr4:52455043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B48,B60,C29
`Chr4:52455963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C62,C84
`Chr4:52455984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B48,B60,C29
`Chr4:52456292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:52456301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:52459748`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr4:52459748`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805283.1

638 aa

319

638

Exo70_N

Exo70_C

PF20669 Exo70_N 70-152 aa PF03081 Exo70_C 274-626 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805283.1`	Pfam	`PF20669`	Exo70_N	Repeat	70	152	5.5e-20	72.1	Exocyst complex component Exo70 N-terminal
`XP_057805283.1`	Pfam	`PF03081`	Exo70_C	Repeat	274	626	1.5e-126	423.2	Exo70 exocyst complex subunit C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949300.1
TATGGTATAGTACTATATAGGAGTATATTTTTTTGAAGATAGGGAAAACTATATATATGTAAGCTGCCATTTCTTTGCATAGCCAAAGCTCCAATCGTGGTTTAATTTGACATTGCGCAAGAAAACCCTAACGCATCTCGCCATGATCGATAGATACAGTCTCTGAGAATCGGACGCGACCAGAAAAATGGGGTCGTACGCCGTCGCGATGGAAACCCTAACGGAGCGCGCCGCGCTGATGAGAGAATCGATGCAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020478
ATGGGGTCGTACGCCGTCGCGATGGAAACCCTAACGGAGCGCGCCGCGCTGATGAGAGAATCGATGCAGAAAACCCAGGTGATCACGGACAACGTCGTCACCATTTTAGGCTCCTTCGACCACCGCCTCTCCGCCCTCGAGACCGCCATGCGCCCCACGCAGTTGAAAACGCATTCGATAAGGAGGGCGCACGAGAACATCGACAAGACACTCAAGACTGCCGAGGCTGTTCTCGAGAAATTTGATCGCTCACGCGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805283.1
MGSYAVAMETLTERAALMRESMQKTQVITDNVVTILGSFDHRLSALETAMRPTQLKTHSIRRAHENIDKTLKTAEAVLEKFDRSREAEAKILRGPHEDLESYLEAVEQLRGIIQFFTGNKNFKSGIGIVNQANNLLGKAILKLEEEFRQLLTSYSKPIEPDLLFDCLPNSMRPSSGSPREGEPAGKKSSDHHNKSLETVVYKLPTLIPPRIMPLLQEISKQMIQAGHQQQVAILYREARSAAVEQTLRKLGVERLGKDEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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