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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003620`

染色体: Chr04 坐标: 52691458-52695462 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003620`
名称	SmilChr04G003620
描述	uncharacterized SmilChr04G003620
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52691458 - 52695462 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020493`
GeneID	`131020493`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020493`
原始查询	`LOC131020493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820334]; symbol=AT3G11620; hit=AT3G11620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820334]; symbol=AT3G11620; hit=AT3G11620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11620` (AT3G11620) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820334] identity=58.7; qcov=0.904; evalue=6.21e-136; confidence=high
Rice	`Os01g0958800` - identity=51.2; qcov=0.586; evalue=1.74e-71; confidence=medium
GO	GO:0005811 (lipid droplet); GO:0016298 (lipase activity); GO:0019915 (lipid storage)
KEGG	-
Pfam	PF10230 (LIDHydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020493

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805327.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057805327.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057805327.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805327.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805327.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52691534`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A23,A6,A8,B107,B108,B119,B2,B25,B45,B64,B97,C15,C21,C23,C34,C37,C40,C51,C63,C64,C66,C79,C87,C9
`Chr4:52691542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:52693632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:52693895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52694447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:52694462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C7
`Chr4:52694487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C58
`Chr4:52694780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C58
`Chr4:52695167`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A23,A6,A8,B10,B107,B108,B119,B2,B25,B45,B64,B97,C15,C21,C23,C34,C40,C51,C63,C64,C66,C79,C87,C9
`Chr4:52695223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:52695258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805327.1

343 aa

172

343

LIDHydrolase

PF10230 LIDHydrolase 67-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805327.1`	Pfam	`PF10230`	LIDHydrolase	Family	67	316	1.8e-69	235.2	Lipid-droplet associated hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949344.1
AAAAAAAAAAGTTTATTTGATAGTATAAATAAGATAGAAAAACACACACACACACACACACACAAGAAATGCCGCAATTGCTTCCGAAAATTGATGCCACATGCTGTTTGCGATTTGACGAGTGGAGCAAATTTCTGGCGAAGTGTATCCACTCGCAAATGGGAAGTGAAAGCAAGAGCTTGGTCGAGAAGAAGAATGCTAATTTAAGGCTTGTTAATATTTCTGGATTTAAGACTGAATTGTTGGAGATTAATAGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020493
ATGCCGCAATTGCTTCCGAAAATTGATGCCACATGCTGTTTGCGATTTGACGAGTGGAGCAAATTTCTGGCGAAGTGTATCCACTCGCAAATGGGAAGTGAAAGCAAGAGCTTGGTCGAGAAGAAGAATGCTAATTTAAGGCTTGTTAATATTTCTGGATTTAAGACTGAATTGTTGGAGATTAATAGCCCCGAGCCTACGTTACATGTGTTGTTTATTCCAGGCAACCCAGGTGTTATTTCATTTTACACTGATTTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805327.1
MPQLLPKIDATCCLRFDEWSKFLAKCIHSQMGSESKSLVEKKNANLRLVNISGFKTELLEINSPEPTLHVLFIPGNPGVISFYTDFLESLYELLGGTASVTGIGHISHSQKNWESQRLFSLEEQINHKINFIEQELQDVEVPIILVGHSIGSYISLEMLKRSRKKVIYCIGLYPFLAVNTASSTQSSIRRLAMSPALCTGISFIGAMLGALPSGITNFFLKISIGKSWSSSAAEALCTHVLKYHTIRNVLYMAMTEFQTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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