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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003623`

染色体: Chr04 坐标: 52725006-52726648 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003623`
名称	SmilChr04G003623
描述	putative H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52725006 - 52726648 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020496`
GeneID	`131020496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020496`
原始查询	`LOC131020496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein 1
产物	putative H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein 1
Arabidopsis	`AT3G03920` (AT3G03920) H/ACA ribonucleoprotein complex, subunit Gar1/Naf1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821062] identity=92.1; qcov=0.51; evalue=2.67e-65; confidence=medium
Rice	`Os11g0579800` - identity=85.3; qcov=0.515; evalue=7.48e-65; confidence=medium
GO	GO:0000454 (snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis); GO:0031429 (box H/ACA snoRNP complex); GO:0034513 (box H/ACA snoRNA binding); GO:0042254 (ribosome biogenesis)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04410 (Gar1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805330.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057805330.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057805330.1`
4	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057805330.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805330.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52725697`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,A10,A4,B105,B114,B12,B129,B13,B130,B131,B134,B136,B137,B31,B36,B71,B72,B98,C12,C27,C3,C46,C56,C64,C74,C83,D2,D8
`Chr4:52725699`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A1,A10,A4,B105,B114,B12,B129,B13,B130,B131,B134,B136,B137,B31,B36,B71,B72,B98,C12,C27,C3,C46,C56,C64,C74,C83,D2,D8
`Chr4:52725703`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B31,C3
`Chr4:52725703`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B31,C3
`Chr4:52726348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B140,B41,B94,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805330.1

198 aa

198

Gar1

PF04410 Gar1 49-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805330.1`	Pfam	`PF04410`	Gar1	Domain	49	135	4.2e-28	97.7	Gar1/Naf1 RNA binding region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949347.1
GATAAAGTGATGGCTTCCGTATCCGAGGGATTCGTAATCGGGAAAGATCTGTATTATTTCGGCAGGGCCGTCTGTGACGTCACACATAAAGGCCGATCAGGAAGCTAATACGGTGTATTCTAGATAAAAGAAAAGTTGGGCTTTGAGAAAACTAGATAAAAGAAAATCTGTAGTATATGATAAAATTGGGCTTTGATATTGGTGGGCCGACAGGCCATAGGCCCGATCATGAAGCTCGCAGTTTACTTAAACCCTAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020496
ATGAGGCCTCCCAGGGGACGCGGCGGCGGAGGCTTTAGGGGTGGCCGAGACGGCGGCGGACGTGGCGGCCGTTTCGGTGGTGGCGGCCGTTTCGGCGGTGGCGGAGGTCGTTTTGGTCCTCGCGACGAAGGCCCTCCTTCTGAAGTCGTCGAGATTTCGACATTTGTTCATGCTTGTGAGGGCGATGCGGTGACGAAGCTGTCTCACGAGAAAATACCTTACTTCAATGCCCCAATTTACCTTGAGAACAAGACCCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805330.1
MRPPRGRGGGGFRGGRDGGGRGGRFGGGGRFGGGGGRFGPRDEGPPSEVVEISTFVHACEGDAVTKLSHEKIPYFNAPIYLENKTQIGKVDEIFGPINESFFSIKMMEGIVATSYSAGDKFFIDPAKLLPLARFLPQPKGQGQSARGGGRGGGRGGGRGGFRGGGGGGFRGRGAPRGGRSGFRGGGRGSGGFRGRGRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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