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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003648`

染色体: Chr04 坐标: 52980974-52982858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003648`
名称	SmilChr04G003648
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52980974 - 52982858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020521`
GeneID	`131020521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020521`
原始查询	`LOC131020521`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
Arabidopsis	`AT4G34340` (TAF8) TBP-associated factor 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829584] identity=43.3; qcov=0.992; evalue=1.59e-90; confidence=medium
Rice	`Os12g0574800` - identity=43.2; qcov=0.932; evalue=1.28e-78; confidence=medium
GO	GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07524 (Bromo_TP); PF10406 (TAF8_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805362.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805362.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805362.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805362.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52981756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:52981842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B127
`Chr4:52981922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:52981950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B114,B131,B134,B46
`Chr4:52982009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr4:52982072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C76
`Chr4:52982150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B36,C9
`Chr4:52982160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B114,B131,B134,B46
`Chr4:52982245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C46
`Chr4:52982246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C76
`Chr4:52982354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B114,B131,B134,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805362.1

370 aa

185

370

Bromo_TP

TAF8_C

PF07524 Bromo_TP 26-95 aa PF10406 TAF8_C 162-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805362.1`	Pfam	`PF07524`	Bromo_TP	Domain	26	95	1.3e-19	70.6	Bromodomain associated
`XP_057805362.1`	Pfam	`PF10406`	TAF8_C	Domain	162	210	2.6e-20	73.3	Transcription factor TFIID complex subunit 8 C-term

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949379.1
GACTCCGCTTATAAATACCCCACTCTGAGCTCTCTGTTTTGACTTTCTCGAATTTCTCTCTCTTCTCGATCCAAATTTCCATTTTTAGATTCGCAGTAGAGTTTTATCACTCCACCATAAAATCCCCAAATCAAATTCCATTTCCCCTCAAAACTGTCATCTTCAAAGTTAAAACCCTAGAGTGATGATTCTTTTTCTCTCTCTAGGGTTTTATCACAATTGAATTCAATCGCGCTCTAAAAAAATATTCTAATTTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020521
ATGAGCGATGGAGGTGAAGCTGAAGGCAGGAGAGACGAACAGAATGATTCGAATTTGCGATCTGGTGCTGGTGATTATAGTCGAGCAATATCAAGAGTTGCGATGGTTCAAATATGCGAGGGCATTGGGTTTGAAGGATTCAACGAGTCTGCTCTTGATTCGCTTGCTGATATTGCGATTAGGTACATCTGTGAGTTAGGTAAAACCTCTAGATTTTATGCGAATTTAGCTGGTAGGACGGGTTGCAACGTCTTTGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805362.1
MSDGGEAEGRRDEQNDSNLRSGAGDYSRAISRVAMVQICEGIGFEGFNESALDSLADIAIRYICELGKTSRFYANLAGRTGCNVFDIVQALEDLGTPQGFTGASEVHADCAVSSGAIREIKEYVEAADEVPFAQPVPQFPVIRERRMIPSFLQMGETPAFKHVPPWLPAFPDPHTYVRTPVWNERLSDARTDKIELARQHRKAERSLLSLQQRLVCNGSSVATTSAEPYNEGNGLEVNNNGNPSFENPLEVREIDVSQIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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