当前解析结果
SmilChr04G003649| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003649 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003649 |
| 描述 | membrane magnesium transporter |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 52989568 - 52991514 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020522 |
|---|---|
| GeneID | 131020522 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020522 |
| 原始查询 | LOC131020522 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | membrane magnesium transporter |
| 产物 | membrane magnesium transporter |
| Arabidopsis | AT5G03345 (AT5G03345)membrane magnesium transporter-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831867] identity=68; qcov=0.981; evalue=2.79e-48; confidence=medium |
| Rice | Os12g0566400- identity=61.9; qcov=1; evalue=4.25e-49; confidence=medium |
| GO | GO:0005769 (early endosome); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022890 (GO:0022890); GO:0072546 (EMC complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10270 (MMgT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020522 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057805363.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057805363.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057805363.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057805363.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805363.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:52990889 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,D10 |
Chr4:52991088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,C76 |
Chr4:52991246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B50,B6,B81 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805363.1PF10270
MMgT 9-60 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805363.1 |
Pfam | PF10270 |
MMgT | Family | 9 | 60 | 3.3e-06 | 28.3 | Membrane magnesium transporter |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。