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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G001770

染色体: Chr01 坐标: 32570873-32573316 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G001770
名称SmilChr01G001770
描述proline-rich receptor-like protein kinase PERK14
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向32570873 - 32573316 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131020535
GeneID131020535
locus_tag-
NCBI NameLOC131020535
原始查询LOC131020535

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述proline-rich receptor-like protein kinase PERK14
产物proline-rich receptor-like protein kinase PERK14
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131020535

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057805403.1
2 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057805403.1
3 Nucleoplasm 核质 0.80000 XP_057805403.1
4 Cytosol 细胞质基质 0.40000 XP_057805403.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057805403.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr1:32571017 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B113,B98
Chr1:32571045 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B130,B71,C48,C61,C68
Chr1:32571065 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 C35,C64,C66
Chr1:32571101 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B20,C36
Chr1:32571108 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B1
Chr1:32571152 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A11,B138
Chr1:32571179 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A2
Chr1:32571184 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B32,B36,C48
Chr1:32571198 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B110,B16,B8,B88
Chr1:32571203 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B61,B7,C71
Chr1:32571206 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B110,B16,B8,B88
Chr1:32571210 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B20,B98,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057949420.1
CGAGCTTTCTAAAATGATTTAATGATATAATGATGTTATGAGTTTATCAAATAAATCGAGATAAATGATATTTGAGAACTGTTTGACTTGCCAATTTTTGATGTTGAGCTTGTGTGTTACCCTCTACTGATGAGACGAATTCGGTCCTGCCACAAGCGGGATTTTGTGCACAGAGGTGACTGTGAGCCGTCTTCGGGTCGGCCGGTCACGGTACTTGAGAGGGAGGCCTACTTCTCAGTACCTTTGATGATGAGTAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131020535
ATGCCGAGTCATATCGAGACAGCGATGCAGCGATGGTTCAGGGAGTATATCCCGGACGAGGATGACACCTTGGGTGAACTTCTGGCACACTATCACCGACGATGGAGGAGGGCTATTCCCTATGGGATCGATGGCGCGGAGGCCATTACGCTTTTGATTCCACTACTGCCACCTTTGTGGCGAGACTGGGCGACATCTTTAGTGCCCCAGTACGTAGATACTACCTGGTTGGAGGGCATCAGGTACGGAGACCTTAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057805403.1
MPSHIETAMQRWFREYIPDEDDTLGELLAHYHRRWRRAIPYGIDGAEAITLLIPLLPPLWRDWATSLVPQYVDTTWLEGIRYGDLSGFIATLSHRYFAHGDPPSPPYGELEGPAQGRELVVVPPPLEEPFLMAPLPPADPISVSLESDDPEPMVFEPYSPGIERDPFAFVSLIPSPSADFPPWDLTPATTPLPLPPVESTQPIVSTESETQHVPSDPYPRVAPLPELGTLAFQTYMHPILYSPYRDAQEGGSRPARSDSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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