当前解析结果
SmilChr01G001770| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001770 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001770 |
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 32570873 - 32573316 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020535 |
|---|---|
| GeneID | 131020535 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020535 |
| 原始查询 | LOC131020535 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| 产物 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020535 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805403.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057805403.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057805403.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057805403.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805403.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:32571017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,B98 |
Chr1:32571045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B71,C48,C61,C68 |
Chr1:32571065 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C35,C64,C66 |
Chr1:32571101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C36 |
Chr1:32571108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr1:32571152 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,B138 |
Chr1:32571179 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr1:32571184 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B32,B36,C48 |
Chr1:32571198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B16,B8,B88 |
Chr1:32571203 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B61,B7,C71 |
Chr1:32571206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B16,B8,B88 |
Chr1:32571210 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B20,B98,C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。