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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003660`

染色体: Chr04 坐标: 53076404-53079764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003660`
名称	SmilChr04G003660
描述	uncharacterized SmilChr04G003660
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53076404 - 53079764 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020536`
GeneID	`131020536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020536`
原始查询	`LOC131020536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818276]; symbol=AT2G37020; hit=AT2G37020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818276]; symbol=AT2G37020; hit=AT2G37020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37020` (AT2G37020) Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818276] identity=72.4; qcov=0.84; evalue=3.47e-132; confidence=high
Rice	`Os10g0443200` - identity=68.5; qcov=0.877; evalue=3.2e-127; confidence=high
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016070 (RNA metabolic process); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01997 (Translin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805407.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057805407.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057805407.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057805407.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53076457`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr4:53076457`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr4:53076591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:53076596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:53076600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53076675`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr4:53076675`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr4:53076694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53077116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A7,C76
`Chr4:53079233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:53079513`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B107,B115,B71,B78,B83,C25,C42,C54,C59,C73,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805407.1

293 aa

146

293

Translin

PF01997 Translin 83-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805407.1`	Pfam	`PF01997`	Translin	Family	83	275	3.5e-56	191.1	Translin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949424.1
AAGAAGGCGGTTTCTGTAGCAAACATGAAAACGGCGTTTCGAAGCGCCATCTGTGCTACACTCGCATTTTCCTCCCGCTCCCTAAACCCTACCCACCACCGCGACTCTCTCATTCTCCTCCACCGCCGCGCCTCTGTTTTTCCGGCTATTCCTTCTCCTTTCACTTCAATGGCAAGCGGCGACGGCTCCGACGCTGCTCTCTCATCCACCATCCACGTGCTGGAAAAGCAGTTCGAGGAGTTCCGCCACCAGCTCGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020536
ATGAAAACGGCGTTTCGAAGCGCCATCTGTGCTACACTCGCATTTTCCTCCCGCTCCCTAAACCCTACCCACCACCGCGACTCTCTCATTCTCCTCCACCGCCGCGCCTCTGTTTTTCCGGCTATTCCTTCTCCTTTCACTTCAATGGCAAGCGGCGACGGCTCCGACGCTGCTCTCTCATCCACCATCCACGTGCTGGAAAAGCAGTTCGAGGAGTTCCGCCACCAGCTCGATGATTCCGGCAGCTTGCGCGATCGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805407.1
MKTAFRSAICATLAFSSRSLNPTHHRDSLILLHRRASVFPAIPSPFTSMASGDGSDAALSSTIHVLEKQFEEFRHQLDDSGSLRDRIRSVSFEIESATRLMHSSLMLVHQSRPIPEVLEKAKGQIDVLRELFSKLAEIMRECPGQYYRYHGDWRSETQAVVSVLAFMHWLETESLLLHAEAEEKLGLNPSEFGLDTEDYLTGICFMSNDLPRYVVNRVTAGDYDCPRKVLMFLTDLHAAFRMLNLRNDFLRKKFDGMKYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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