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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003664`

染色体: Chr04 坐标: 53090879-53094025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003664`
名称	SmilChr04G003664
描述	adenosine kinase 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53090879 - 53094025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020539`
GeneID	`131020539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020539`
原始查询	`LOC131020539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenosine kinase 2
产物	adenosine kinase 2
Arabidopsis	`AT5G03300` (ADK2) adenosine kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831882] identity=84.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0625500` - identity=81.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004001 (adenosine kinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006166 (purine ribonucleoside salvage)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00294 (PfkB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805410.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805410.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057805410.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805410.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53091145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:53091200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B22,C74
`Chr4:53091217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B29,C14
`Chr4:53091350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C80
`Chr4:53091417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:53091418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B57,B79
`Chr4:53091428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B63,B71,B85
`Chr4:53091444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B8,B88,C67
`Chr4:53091696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr4:53091708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:53092001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:53092125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B29,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805410.1

340 aa

170

340

PfkB

PF00294 PfkB 27-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805410.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	27	334	3.5e-71	240.7	pfkB family carbohydrate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949427.1
ACCCACTCTTTTTCCCCAAATTCTATTATACTTTTAGCAGCTATATATATGTTCACCCCGAGCAACAACTTCACAGTGAGCTCATTCATTCACCCCTCTCAATTCTCTAAATTATTTTCACACGCATTTTTTATTTGAAATCGGGAGTTGAGATGGAGACCGATGGAATTCTGCTTGGAATGGGGAATCCTCTGTTGGATATATCCGCCGTCGTTGATCAAGGGTTCTTAGACAAGTACGATGTTAAATTGAACAATGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020539
ATGGAGACCGATGGAATTCTGCTTGGAATGGGGAATCCTCTGTTGGATATATCCGCCGTCGTTGATCAAGGGTTCTTAGACAAGTACGATGTTAAATTGAACAATGCGATCCTGGCTGAGGATAAGCATTTGCCGATGTATGAAGAAATGACATCCAAGTACAAAGTGGATTTTATTGCTGGAGGGGCTACTCAAAATTCAATAAGAGTTGCCCAGTGGATGCTACAAATTCCTGGTGCAACCAGCTACATGGGTTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805410.1
METDGILLGMGNPLLDISAVVDQGFLDKYDVKLNNAILAEDKHLPMYEEMTSKYKVDFIAGGATQNSIRVAQWMLQIPGATSYMGSIGKDKFGEEMKKHAKLAGVNVHYYEDELPTGTCAVCVLGGERSLIANLSAANCYKPDHLKKPENWALVEKAKYYYMAGFFLTVSPESILLVAEHAAAKNKIFATNLSAPFICEFFKDAQEKVLPYTDFVFGNETEALTFSRVHGYETENIQEIALKISQLPKASGTHKRITVIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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