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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001724`

染色体: Chr01 坐标: 31775044-32917134 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001724`
名称	SmilChr01G001724
描述	uncharacterized SmilChr01G001724
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31775044 - 32917134 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020541`
GeneID	`131020541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020541`
原始查询	`LOC131020541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41220` (GSTT3) glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=29.6; qcov=0.546; evalue=5.65e-10; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=32.8; qcov=0.721; evalue=7.09e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805416.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805416.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805416.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805416.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32915997`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A1,A19,A20,A22,A9,B10,B112,B113,B117,B12,B124,B125,B127,B132,B138,B15,B2,B21,B22,B24,B32,B38,B39,B4,B48,B51,B52,B55,B56,B6,B63,B7,B70,B74,B76,B82,B85,B87,B92,B93,B94,B99,C10,C2,C23,C24,C26,C3,C35,C37,C41,C43,C44,C47,C49,C50,C54,C55,C59,C67,C69,C7,C73,C75,C80,C85,C87,D10,D4,D7,D8
`Chr1:32915998`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	151	A10,A11,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A4,A6,B1,B100,B101,B104,B105,B107,B109,B11,B112,B114,B115,B12,B120,B123,B124,B125,B127,B129,B130,B131,B134,B135,B136,B137,B14,B140,B16,B17,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B36,B37,B4,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B62,B63,B66,B67,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C21,C22,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C45,C46,C47,C50,C51,C52,C53,C57,C59,C63,C64,C65,C66,C69,C7,C70,C73,C74,C76,C78,C81,C83,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr1:32916014`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B113,B48,B55,B85,B87,C7,D4
`Chr1:32916081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B65
`Chr1:32916082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:32916126`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A13,A21,B108,B109,B122,B138,B16,B49,B77,B81,C13,C39,C44,C46,C56,C67,C87
`Chr1:32916129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:32916139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B86,C16,C54
`Chr1:32916148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B2,B41,B52,C14
`Chr1:32916168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B78,C16,C35,D9
`Chr1:32916169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:32916202`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A5,B114,B118,B3,B30,B47,B7,B70,B76,B95,C11,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805416.1

359 aa

180

359

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 259-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805416.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	259	347	3e-07	32.1	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949433.1
ACCCCAAAATTACTCTTCATCTACATATTTAGTTCTTCTCCAAAAAAATTAGAAATATCATGAGTGGACTTTCAAATTGGTTTGGTCCATATGGATCAAATTCAATTTCACAAAATTCAAGTTCTCCTTCACAAAATTGTAACGATCCTTCTCAAAATTCCGACATTCGCCCTCCAAATTTCTCTTGGCCAAATATGTCTAATCCTCAAATATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCCCTTCATTTCAATTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020541
ATGAGTGGACTTTCAAATTGGTTTGGTCCATATGGATCAAATTCAATTTCACAAAATTCAAGTTCTCCTTCACAAAATTGTAACGATCCTTCTCAAAATTCCGACATTCGCCCTCCAAATTTCTCTTGGCCAAATATGTCTAATCCTCAAATATATCCCAACAATCCCATGAGTCAATCAGCCCCTTCATTTCAATTTTCATCCCAAGTGCATCCATCTCAGGGATTTCAGCCATACGGATATCCTCAACAATGGTATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805416.1
MSGLSNWFGPYGSNSISQNSSSPSQNCNDPSQNSDIRPPNFSWPNMSNPQIYPNNPMSQSAPSFQFSSQVHPSQGFQPYGYPQQWYPPPGFSPLGYHSHGFMFSDSSRRTSVDGSGTDGGTPSSGKAVQGLENINLSVEPSSDDDEENTNMRRVFYSDEECEVLAQCYIDISIDSVVGNEQKMDKMWKCIAKAYNENRPANTPSRKFKQLKAHFYKMQKQVKWFSECYNRIASIWKSGANDADIMEMAQTEYKQHHGTKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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