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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003673`

染色体: Chr04 坐标: 53190742-53194374 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003673`
名称	SmilChr04G003673
描述	auxin response factor 18-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53190742 - 53194374 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020549`
GeneID	`131020549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020549`
原始查询	`LOC131020549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 18-like
产物	auxin response factor 18-like
Arabidopsis	`AT4G30080` (ARF16) auxin response factor 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829131] identity=55.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0685700` (OsARF10) - identity=56.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805428.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805428.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805428.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805428.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53191828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr4:53191971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr4:53192004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C58
`Chr4:53192046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr4:53192166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:53192291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:53192349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr4:53192349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr4:53192683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53193067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B1,C39,C73,C82
`Chr4:53193095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B125,B90,B92,C87
`Chr4:53193214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805428.1

681 aa

340

681

ARF_AD

PF02362 B3 121-222 aa PF06507 ARF_AD 311-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805428.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	121	222	1.6e-23	83.2	B3 DNA binding domain
`XP_057805428.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	311	394	3.1e-33	114.2	Auxin response factor ancillary domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949445.1
ACCGAAGACAAAAAAAAAAGGCAAAACCGGAAATCTACTAAAGAAAGGTGGAAATGGTGTAGTTTGTTTCAAGATCTTTGTTTGTTTAATAGTGGAATCCTAAAAGGTGCATCAGAAGTTTCTTCAGATCCGATAAAGAAGGTCAGAAATATTACTATATTATTCGGTAACGGATTATAGTTTTTTTCTTTTCAAAATAATAGTAATAATATTGAGGCAAAAGCGGAAAAATTAAAACAGTAGGTTGGCTGAAAGACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020549
ATGATTACGTTTATGGAATCTAAGGAGAGAAGCAAAGAGAGTGAGAGATGTTTGGATTCTCAGCTGTGGCACGCCTGCGCCGGCAGCATGGTGCAAATGCCGCCGGTGAATTCGAAGGTCTTCTACTTCCCACAAGGCCATTTGGAGCACGTTTGTGGCAATCTTGATCTTAGGAATTGTCCTAGGTTGCCTGCCTATGTACCTTGTAGGGTGTCTGCAGTTAAGTTCATGGCTGATCCTGAGACGGATGAGGTTTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805428.1
MITFMESKERSKESERCLDSQLWHACAGSMVQMPPVNSKVFYFPQGHLEHVCGNLDLRNCPRLPAYVPCRVSAVKFMADPETDEVFAKIRLAPVAGDEVDLDKDGAAEVDGVENRDKPTSFAKTLTQSDANNGGGFSVPRYCAETIFPRLDYSADPPVQTILVKDVHGEVWKFRHIYRGTPRRHLLTTGWSTFVNHKKLVAGDSIVFLRAENGDLCVGVRRAKNGIGGGPQVPPRWSPGGGGPAVPYGGFSMFLREDESK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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