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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003680`

染色体: Chr04 坐标: 53252028-53253249 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003680`
名称	SmilChr04G003680
描述	uncharacterized SmilChr04G003680
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53252028 - 53253249 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020555`
GeneID	`131020555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020555`
原始查询	`LOC131020555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G03390; symbol=AT5G03390; hit=AT5G03390; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G03390; symbol=AT5G03390; hit=AT5G03390; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03390` (AT5G03390) - identity=26.3; qcov=0.994; evalue=7.37e-14; confidence=low
Rice	`Os01g0328300` (OsFbox009) - identity=21.1; qcov=0.953; evalue=1.52e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805435.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805435.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057805435.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805435.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53252162`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A4,A9,B111,B121,B140,B23,B53,B89,C18,C19,C26,C31,C35,C44,C50,C53,C55,C62,C71,C74,C83,D11,D9
`Chr4:53252220`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C33
`Chr4:53252220`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C33
`Chr4:53252227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:53252247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:53252307`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B106,B43,B76,B86,B93,C27,C39,C51,C67
`Chr4:53252313`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B106,C39
`Chr4:53252313`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B106,C39
`Chr4:53252320`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B132,B17,B18,B39,B42,B54,B6,B73,C19,C58,D1
`Chr4:53252323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr4:53252326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C39,C87
`Chr4:53252336`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805435.1

363 aa

182

363

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 67-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805435.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	67	327	1.3e-28	100.9	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949452.1
ATGTGGGGGTCAATATTGCGGCGCGTGATTTCGCACTCCCACCAGCAATCTCGAAGACTCTCCGGAGGGCCGTGGTTGATGCTTCCACCGGCGCGGTCAGGGAATACGGCGGCGTACAATTTATACTCTCCCGTGAAGGGACAAGTAGTGAGCTTCAACATCAACGGCAATGATGAGACAGTAGAGGTTATGCAGGACCCCGCAACTAGGCTGGTGGGTTCGTCGCACGGCTGGCTAGCTCTGTTCAACCCCCGCCGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020555
ATGTGGGGGTCAATATTGCGGCGCGTGATTTCGCACTCCCACCAGCAATCTCGAAGACTCTCCGGAGGGCCGTGGTTGATGCTTCCACCGGCGCGGTCAGGGAATACGGCGGCGTACAATTTATACTCTCCCGTGAAGGGACAAGTAGTGAGCTTCAACATCAACGGCAATGATGAGACAGTAGAGGTTATGCAGGACCCCGCAACTAGGCTGGTGGGTTCGTCGCACGGCTGGCTAGCTCTGTTCAACCCCCGCCGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805435.1
MWGSILRRVISHSHQQSRRLSGGPWLMLPPARSGNTAAYNLYSPVKGQVVSFNINGNDETVEVMQDPATRLVGSSHGWLALFNPRRRVFFLSNPLSGCRIDLPHPPTDFIVPPLKVIVSSSSPDDDDCRALMMFDSDAYSYVCRPGRSAWTLFGKFAYEDFVYSAARKRFLCVLQDQFMHDSDDEELEPWDLECWNVVQEPEPTIDWKVETLDSDFLHKQMREVSFRFKRYMRYLVADAYVVTRYFNWYKKYEKTVGFDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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