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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003683`

染色体: Chr04 坐标: 53259886-53260749 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003683`
名称	SmilChr04G003683
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53259886 - 53260749 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020560`
GeneID	`131020560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020560`
原始查询	`LOC131020560`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
Arabidopsis	`AT5G03170` (FLA11) FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831914] identity=53.2; qcov=0.845; evalue=5.96e-62; confidence=high
Rice	`Os05g0163300` (OsFLA9) - identity=55; qcov=0.634; evalue=2.38e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057805443.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057805443.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057805443.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805443.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805443.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53260202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:53260260`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B101,B108,B117,B16,B51,B54,B59,B67,B90,B92,C13,C27,C30,C31,C46,C56
`Chr4:53260282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C53,D11
`Chr4:53260316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B68,C8,C82
`Chr4:53260348`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	B124,B140,B2,B40,B48,B60,B64,B66,B74,B78,B98,C16,C46,C65,D1,D7
`Chr4:53260370`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A23,B110,C14,C28,D8
`Chr4:53260370`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A23,B110,C14,C28,D8
`Chr4:53260420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C39
`Chr4:53260477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B72,C39
`Chr4:53260614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C39
`Chr4:53260619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B38,B5,B72,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805443.1

238 aa

119

238

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 46-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805443.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	46	179	3e-20	73.4	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949460.1
CACCTTTCTTGAAAACTCTCCAAGCCTTTCGAGACAAAACAAGATGAAAAAGCTATTCATCCAATTCCCAGTTCTCCTCATCCTTATTCACTGCATCCTAACTACTGCCCAGTCCCCAGCAGCAGCCCCTGCACCGCCTGGGCCGCCCAATGTGACTGCCATCCTCGAGAAGGATGGCCGTTTTACCATATTCATCAAGCTGCTGCAGAGCACGAAAGTAGCAGACAACCTCAACTCGCAGCTTAATGATTCAAACCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020560
ATGAAAAAGCTATTCATCCAATTCCCAGTTCTCCTCATCCTTATTCACTGCATCCTAACTACTGCCCAGTCCCCAGCAGCAGCCCCTGCACCGCCTGGGCCGCCCAATGTGACTGCCATCCTCGAGAAGGATGGCCGTTTTACCATATTCATCAAGCTGCTGCAGAGCACGAAAGTAGCAGACAACCTCAACTCGCAGCTTAATGATTCAAACCAAGGGTTAACTCTCTTTGCGCCACCAGATAGTGCTTTCTCCAGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805443.1
MKKLFIQFPVLLILIHCILTTAQSPAAAPAPPGPPNVTAILEKDGRFTIFIKLLQSTKVADNLNSQLNDSNQGLTLFAPPDSAFSSLKVGMLNSFTDDQKVDLVQFHVLPYYLPQSQFETASNPLNTQAGGSSQLLAMNVTAVGDQVNITTGETNATVSNTIYDENELVVYQVDKVLLPLRFYVPLPPPPLSPPPPKKAAPKDSPAYSAPVDSSSTKCQSRRVIHAMICVLLALAAVP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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