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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003698`

染色体: Chr04 坐标: 53350102-53352148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003698`
名称	SmilChr04G003698
描述	DNA-binding protein S1FA-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53350102 - 53352148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020574`
GeneID	`131020574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020574`
原始查询	`LOC131020574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-binding protein S1FA-like
产物	DNA-binding protein S1FA-like
Arabidopsis	`AT2G37120` (AT2G37120) S1FA-like DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818288] identity=73; qcov=0.733; evalue=5.19e-15; confidence=low
Rice	`Os04g0408700` (S1FA2) - identity=67.1; qcov=0.814; evalue=7.13e-15; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04689 (S1FA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805471.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805471.1`
3	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	0.80000	`XP_057805471.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057805471.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057805473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53351766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53351795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53351817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B87
`Chr4:53351885`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	131	A1,A10,A11,A14,A16,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A7,A8,B100,B101,B103,B105,B107,B109,B111,B112,B113,B118,B12,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B24,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B47,B48,B5,B53,B54,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B70,B71,B75,B79,B81,B82,B84,B85,B88,B90,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C11,C13,C19,C20,C21,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C35,C4,C40,C41,C45,C5,C51,C57,C58,C6,C61,C62,C68,C69,C7,C70,C77,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,D4,D8,D9
`Chr4:53351906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,D10,D11
`Chr4:53351938`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A15,B54,C5,C75
`Chr4:53351938`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A15,B54,C5,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805471.1

87 aa

S1FA

PF04689 S1FA 25-87 aa

XP_057805473.1

86 aa

S1FA

PF04689 S1FA 24-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805471.1`	Pfam	`PF04689`	S1FA	Family	25	87	4.3e-39	133.2	DNA binding protein S1FA
`XP_057805473.1`	Pfam	`PF04689`	S1FA	Family	24	86	4.2e-39	133.3	DNA binding protein S1FA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949488.1
AAAGTCTGACTTCGTTTCGGAGCACCAACGCACACTCGTCAATCAAATTTAAGACTCTGGCTTCACCCACCTTCCAATAATTCCAATTTTCTCTCTAAAAAAATAAAAAATAAATAAAGGCGATGGAAGCAGATGGTGATTTCGATGTTCCTCCGTCATTTGATCGCGTGAAGAATGCAGCCCGTGATGGTGCAGCACAAGGGTTCAACCCAGGCTTGATCGTCTTACTTGTGATTGGGGGGCTGCTCTTGGCATTCCTT...

XM_057949490.1
CTGACTTCGTTTCGGAGCACCAACGCACACTCGTCAATCAAATTTAAGACTCTGGCTTCACCCACCTTCCAATAATTCCAATTTTCTCTCTAAAAAAATAAAAAATAAATAAAGGCGATGGAAGCAGATGGTGATTTCGATGTTCCTCCGTCATTTGATCGCGTGAATGCAGCCCGTGATGGTGCAGCACAAGGGTTCAACCCAGGCTTGATCGTCTTACTTGTGATTGGGGGGCTGCTCTTGGCATTCCTTGTTGGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020574
ATGGAAGCAGATGGTGATTTCGATGTTCCTCCGTCATTTGATCGCGTGAAGAATGCAGCCCGTGATGGTGCAGCACAAGGGTTCAACCCAGGCTTGATCGTCTTACTTGTGATTGGGGGGCTGCTCTTGGCATTCCTTGTTGGAAATTACGTGCTCTACACTTACGCCCAAAAAACCTTGCCTCCGAAGAAAAAGAAGCCCGTCTCCAAGAAGAAGATGAAGAAAGAACGACTGAAGCAAGGCATATCAGCTCCCGGAGA...

LOC131020574
ATGGAAGCAGATGGTGATTTCGATGTTCCTCCGTCATTTGATCGCGTGAATGCAGCCCGTGATGGTGCAGCACAAGGGTTCAACCCAGGCTTGATCGTCTTACTTGTGATTGGGGGGCTGCTCTTGGCATTCCTTGTTGGAAATTACGTGCTCTACACTTACGCCCAAAAAACCTTGCCTCCGAAGAAAAAGAAGCCCGTCTCCAAGAAGAAGATGAAGAAAGAACGACTGAAGCAAGGCATATCAGCTCCCGGAGAATA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805471.1
MEADGDFDVPPSFDRVKNAARDGAAQGFNPGLIVLLVIGGLLLAFLVGNYVLYTYAQKTLPPKKKKPVSKKKMKKERLKQGISAPGE

XP_057805473.1
MEADGDFDVPPSFDRVNAARDGAAQGFNPGLIVLLVIGGLLLAFLVGNYVLYTYAQKTLPPKKKKPVSKKKMKKERLKQGISAPGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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