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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003702`

染色体: Chr04 坐标: 53365776-53367825 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003702`
名称	SmilChr04G003702
描述	uncharacterized protein At1g28695-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53365776 - 53367825 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020576`
GeneID	`131020576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020576`
原始查询	`LOC131020576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839771]; symbol=AT1G28710; hit=AT1G28710; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839771]; symbol=AT1G28710; hit=AT1G28710; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G28710` (AT1G28710) Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839771] identity=48.8; qcov=1; evalue=1.24e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0731800` (OSJNBa0079G12.19) - identity=45.9; qcov=0.855; evalue=3.62e-77; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03407 (Nucleotid_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805474.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805474.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805474.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805474.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805474.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53366039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B78,B96
`Chr4:53366127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:53366265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53366332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:53366344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:53366476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B44
`Chr4:53366517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D2
`Chr4:53366522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B75,C84
`Chr4:53366621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53366623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B140,B65
`Chr4:53367333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B93
`Chr4:53367602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805474.1

344 aa

172

344

Nucleotid_trans

PF03407 Nucleotid_trans 107-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805474.1`	Pfam	`PF03407`	Nucleotid_trans	Family	107	312	2.5e-56	191.7	Nucleotide-diphospho-sugar transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949491.1
TACTCTTATTTATTTATGGTCAACTATTAGTACTAAATGAGGAATGAGATCCGAAATATAGAGAATTTGATTTAATTAAGAATTATAGCTCTAGGATTCTAGCCATGCCAAACCTTTGTCCTTTTGCATGACTTGTGACTCTAGATTAACCATTTCATTTCACCCTCCAAAATAAAAATTTCTAAATTAATTAGCTTCTTGCTCATGAAAAATTTCTGGAAATATGGAGTGCCACTCTAGTAACAAAAATCTAGCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020576
ATGGAGTGCCACTCTAGTAACAAAAATCTAGCAATCCTCTCTGTATTTCTAGCAGCAATCATACTTCTCAATTATCGTGAAGAGCTAACCACCAATGCCATCTTATTTTATACAGAAAAATCCCATTCCATCAATTCCAACTCGTCATTGGTGCATCGAGACGAGCTCCGAATAGTTTTGGAGAAGGCCTCAACGCCAGACAAGACGGTGATCATCGCTGTCATCAACGAGGCCTACGTCGAACCATACGAGAACGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805474.1
MECHSSNKNLAILSVFLAAIILLNYREELTTNAILFYTEKSHSINSNSSLVHRDELRIVLEKASTPDKTVIIAVINEAYVEPYENDYPSMFDIFLEGFWIGEKTRPLLRHLLVVSMDKTAHERCRFRHLNCYFLAAEQGGGAGDFSGEKLYMSGEFIEMMWRRTAFLLDVLKRGYGFIFTDTDVIWVRDPFARLRKNGTFDLQISTDHFTGDPFSEDNPINTGFYAIRSSNKTTSLFEKWYDMRSNATGMKEQDVLQMLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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