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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001731`

染色体: Chr01 坐标: 31898722-31900886 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001731`
名称	SmilChr01G001731
描述	uncharacterized SmilChr01G001731
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31898722 - 31900886 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020580`
GeneID	`131020580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020580`
原始查询	`LOC131020580`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0543900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0543900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0543900` - identity=39.7; qcov=0.818; evalue=9.43e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805481.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805481.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805481.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805481.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31899848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C82
`Chr1:31899924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B5,B51,B70
`Chr1:31900114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B15,B28,B76,D9
`Chr1:31900146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:31900146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:31900161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr1:31900230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:31900253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:31900393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:31900487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B13
`Chr1:31900822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A19,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805481.1

286 aa

143

286

DUF4216

PF13952 DUF4216 109-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805481.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	109	182	3e-23	82.9	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949498.1
CATTTGCGTGAGATACTACGTAAAAATAGGCGCATGTCAAGTTATGATAGACAAAAGCTTCACACTGAAACCTTTCCTGATTGGTTTAAATTTCAAGTAAATGAAATGGCAAACACAAATACTGAAATTGTAGACCAGGATATTCCATTTTTAGCTGCTGGGCCAAGTAAATGGGCTCGTCGTTACACAGGGTATATTGTAAATGGACTGCGTTTTCATACTAAGAAACGGGAGATGAGAAGAAAAACCCAAAATAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020580
ATGTCAAGTTATGATAGACAAAAGCTTCACACTGAAACCTTTCCTGATTGGTTTAAATTTCAAGTAAATGAAATGGCAAACACAAATACTGAAATTGTAGACCAGGATATTCCATTTTTAGCTGCTGGGCCAAGTAAATGGGCTCGTCGTTACACAGGGTATATTGTAAATGGACTGCGTTTTCATACTAAGAAACGGGAGATGAGAAGAAAAACCCAAAATAGTGGAATTTTCTTGAATGCTACTACCAATAGTTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805481.1
MSSYDRQKLHTETFPDWFKFQVNEMANTNTEIVDQDIPFLAAGPSKWARRYTGYIVNGLRFHTKKREMRRKTQNSGIFLNATTNSFSSSKDKNPISGDVSFYGVLKDIIEVRYTNNLKFVLFKCDWVDYNLGLKRDEFNFTLVNFSHLLYRGNRKIDEPFILASQAQQAWYIQDPVDPDWHVALKMTPRAVFNVDPEVNEFESTEDDHISCQQNEPDINNENISWTGADVDGVIVVDAIGEDNIDNFDDEVDEAEYFSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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