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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003707`

染色体: Chr04 坐标: 53395098-53397421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003707`
名称	SmilChr04G003707
描述	carnosic acid synthase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53395098 - 53397421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020582`
GeneID	`131020582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020582`
原始查询	`LOC131020582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carnosic acid synthase-like
产物	carnosic acid synthase-like
Arabidopsis	`AT2G45560` (CYP76C1) cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819164] identity=41.4; qcov=0.99; evalue=8.05e-135; confidence=medium
Rice	`Os03g0248200` - identity=46.3; qcov=0.954; evalue=1.18e-145; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805479.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805479.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805479.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805479.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53395153`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A1,A10,A14,A19,A25,B10,B103,B113,B115,B126,B18,B31,B38,B63,B66,B74,B80,B81,C1,C10,C12,C13,C17,C28,C3,C34,C38,C40,C45,C52,C58,C65,C67,C77,C79,C80,C81,D2,D3,D4
`Chr4:53395258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:53395343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:53395606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B22,C71
`Chr4:53395649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D11
`Chr4:53395811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:53395849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:53396792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:53396875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B18,B38,B39
`Chr4:53396931`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B133,B38,B39
`Chr4:53396931`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B133,B38,B39
`Chr4:53397101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805479.1

505 aa

252

505

p450

PF00067 p450 36-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805479.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	36	487	1e-99	335.1	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949496.1
AAATAGAGGAGAAAGGCATGCAACGGTACAAACGCAACAAACCAGAAAATGGGCGGTTTTATTGTTTTATCCGTCGCCTTTGTAGCAGCATTATCATGTGCTGTATTTGTATTCTCACGGTGGTCGGATTCTCGACGGCGGCGAGCGAAGTTCCCTCCGGGGCCGCCTCGGCTGCCGATCCTCGGCAACATCCTCCAACTCGTCGGATCAGACCCCCACAAATCGTTTGCTCAGCTCGCTCAAACCTACGGCGCCCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020582
ATGGGCGGTTTTATTGTTTTATCCGTCGCCTTTGTAGCAGCATTATCATGTGCTGTATTTGTATTCTCACGGTGGTCGGATTCTCGACGGCGGCGAGCGAAGTTCCCTCCGGGGCCGCCTCGGCTGCCGATCCTCGGCAACATCCTCCAACTCGTCGGATCAGACCCCCACAAATCGTTTGCTCAGCTCGCTCAAACCTACGGCGCCCTAATGTCCCTGAAGATCGGGACTCAAGTGGCGGTGGTGGCGTCGTCGCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805479.1
MGGFIVLSVAFVAALSCAVFVFSRWSDSRRRRAKFPPGPPRLPILGNILQLVGSDPHKSFAQLAQTYGALMSLKIGTQVAVVASSPEIAMEMMQRHGQAFSNRSIPDAIKTHGHERVSWNTIPADSTGWKRIRRVGREKLFSRQALERSEGQRRERLRRLADHVRGFSEQGRVMNVGEATFTTMTDLVFATLFSVDLADYGAANKELREHVNSFTRYIGVPNISDFFPIFAPLDPQGIRRKVGYHLGSLLDFAQSMIDDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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