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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003708`

染色体: Chr04 坐标: 53399293-53401585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003708`
名称	SmilChr04G003708
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53399293 - 53401585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020583`
GeneID	`131020583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020583`
原始查询	`LOC131020583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
产物	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
Arabidopsis	`AT5G51160` (AT5G51160) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835190] identity=34.1; qcov=0.824; evalue=9.76e-66; confidence=low
Rice	`Os03g0281100` (OsSTA96) - identity=27.4; qcov=0.813; evalue=1.94e-20; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805480.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805480.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805480.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805480.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53399543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D2
`Chr4:53399618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:53399733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B14,B41,C22,C39
`Chr4:53399782`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A2,B107,B125,B131,B9,B90,C87
`Chr4:53399793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B19,B91
`Chr4:53399807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B47,C20,C35,C55
`Chr4:53399812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr4:53399838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr4:53399847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A18,B49,B50,B85,C49
`Chr4:53399847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B49,B50,B85,C49
`Chr4:53399876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B14,B41,C22
`Chr4:53399896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805480.1

427 aa

214

427

Ank_2

Ank

Ank_4

Ank

PGG

PF12796 Ank_2 6-94 aa PF00023 Ank 36-62 aa PF13637 Ank_4 40-88 aa PF00023 Ank 71-94 aa PF00023 Ank 178-206 aa PF13962 PGG 286-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	6	94	2.1e-26	93.0	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	36	62	8.9e-25	86.1	Ankyrin repeat
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	40	88	6.1e-20	71.6	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	71	94	8.9e-25	86.1	Ankyrin repeat
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	178	206	8.9e-25	86.1	Ankyrin repeat
`XP_057805480.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	286	392	1.4e-18	67.5	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949497.1
ACTTCTTTATTTAAAATTCTGCAACACCACATCAAACTTCATACACATCCTTTGACCTTGATTATAATAATCATCTAAAAAATACTAGTAAAATGCGTGTCATCACTTCATTAAAAAAACATCCAAACACAAATTTTTAAAGTATGGAGAGGAAGCTGGTTGAGGCGGCCGTGAAGGGAGATGTGCAGCAACTGCAAAACCTGATCAAAGACGATCCCTTGCTGCTGTCGGCTGCGGCTTTGGGAGGCGGCGACGCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020583
ATGGAGAGGAAGCTGGTTGAGGCGGCCGTGAAGGGAGATGTGCAGCAACTGCAAAACCTGATCAAAGACGATCCCTTGCTGCTGTCGGCTGCGGCTTTGGGAGGCGGCGACGCTCCGTTGCACATAGCATGCATTGGGAGCCATCTCGAATTTGTGAAGGAGTTGCTGCTTCATCTGGGCGCCGAATCCGCTGCAGAGCTCAATCAAGAGGGTTTAAGCCCCCTGCACATCGCTTCTGCTAGAGGCGATGTCGAGATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805480.1
MERKLVEAAVKGDVQQLQNLIKDDPLLLSAAALGGGDAPLHIACIGSHLEFVKELLLHLGAESAAELNQEGLSPLHIASARGDVEIVKELLKLGGHLCLAKGRESRIPLHSAVAKGRTRVIAELLSACEGSIAHATARGETCFHLAVKFNQYEAFKVLCDHAVSFGMEEVLNSKDGRGNTVLHIAASKKQYEVFDLLLEKNPYMKNKLEVKSLNNKRRTPFDVLISEGGDCDIEEILTRAAPPTQTIPAGEEQSPEQQQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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