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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001752`

染色体: Chr01 坐标: 32249577-32251817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001752`
名称	SmilChr01G001752
描述	histone deacetylase HDT1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32249577 - 32251817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020591`
GeneID	`131020591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020591`
原始查询	`LOC131020591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase HDT1-like
产物	histone deacetylase HDT1-like
Arabidopsis	`AT5G22650` (HD2B) histone deacetylase 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832328] identity=37.3; qcov=1.01; evalue=3.43e-30; confidence=medium
Rice	`Os05g0597100` (HDT1) - identity=41; qcov=1.02; evalue=4.94e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17800 (NPL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805491.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057805491.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057805491.1`
4	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.40000	`XP_057805491.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057805491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32250282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr1:32250445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:32250719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:32250942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B140,B41
`Chr1:32250979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B12,B131,B138
`Chr1:32250986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:32251008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr1:32251014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,C76
`Chr1:32251045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:32251181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B41
`Chr1:32251507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805491.1

284 aa

142

284

NPL

PF17800 NPL 3-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805491.1`	Pfam	`PF17800`	NPL	Domain	3	94	2.3e-15	57.8	Nucleoplasmin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949508.1
GAATTAAAAGAAAAGTAAAAAAGAAAAATACAGCTATGCATACATTCCTCAATCAAAACCCTAATGAATCAGACGACATTCGCCTATAAAACCCTCCTAAAACCCTCTTTACCTCCTCACCGCTTTCAAAAAATTTCAAAATCATTCACTTCCCAAATTGCTCCTGCGTTAAACAATTCTTTTCGGAGATGGAGTTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGTTGGGGAAAAACTTAAGGTTCAACCTAAGCCTGGAAAATTGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020591
ATGGAGTTTTGGGGAGTTGAAGTTAAGGTTGGGGAAAAACTTAAGGTTCAACCTAAGCCTGGAAAATTGATTCACATCTCACAGGCGGCAATGGGTGAAGTGAAGGATGTTAAAGCGGCCAAGAATGTTCATCTTCGGATGAAAATTGATGATAAGGATTTCATCATTGGATCCCTTGCGGCTGAGATTCGACCTCAACTGATGTTTGATTTGGTGTTTGAGAAGGACTTTGAACTATCCCATGACTTGAAGAATGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805491.1
MEFWGVEVKVGEKLKVQPKPGKLIHISQAAMGEVKDVKAAKNVHLRMKIDDKDFIIGSLAAEIRPQLMFDLVFEKDFELSHDLKNGSVHFMGYIADDPEDEVEFSDFGSESADEEEPIEAKEEAKENGKAKAKSVDAKPAAAAGKAQKEEKVAPKVEEDSDDDEDDSDDEMAFDTSDLSGDSDDEEDEDSSSSEEELPVAKQQQQSKKRPAASAEKSPAAKKAKSATPDKSGKKGQNATPFPAKSAGKTPNKPKEQSPKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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