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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003720`

染色体: Chr04 坐标: 53544759-53548038 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003720`
名称	SmilChr04G003720
描述	nitrate regulatory gene2 protein-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53544759 - 53548038 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020595`
GeneID	`131020595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020595`
原始查询	`LOC131020595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nitrate regulatory gene2 protein-like
产物	nitrate regulatory gene2 protein-like
Arabidopsis	`AT1G02110` (AT1G02110) bZIP domain class transcription factor (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839234] identity=56.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0562700` (REL2) - identity=58; qcov=0.703; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805492.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805492.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805492.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805492.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53544989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C45
`Chr4:53545044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53545160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B68,B72,C45
`Chr4:53545228`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A11,A16,A18,A22,A4,A6,A9,B10,B12,B120,B122,B128,B136,B137,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B55,B57,B61,B65,B74,B81,B84,B85,B89,B98,C1,C11,C18,C21,C3,C35,C39,C4,C40,C43,C48,C67,C69,C72,C85,C86,D8
`Chr4:53545328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:53545544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:53545637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,B60,B98,C16
`Chr4:53545654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C41
`Chr4:53546578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:53546762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr4:53546819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:53546885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805492.1

765 aa

382

765

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 328-632 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805492.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	2.1e-25	89.4	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057805492.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	328	632	2.6e-100	336.5	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949509.1
CTAAAAAAAACATGTCTGCAAAAAAAATGCATGGGACTGAATTTAAATTTTATATAAAACAATTTTATTTAAACAGCAGAAAACTCAAGTAATAAGCGCAGTGGCAGTGTGAAAAATCCCTCCTTCCTCCGCCACCGCCTCCGCCGCCGGCCAATCTCCATCTCGACGAAGGAGAAATGGGTTGCACGCCGTCCAAACTCGACAACGAGGACACGGTGCGGCGCTGCAAGGACCGCCGCCGCCTCATGAAGGAGGCTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020595
ATGGGTTGCACGCCGTCCAAACTCGACAACGAGGACACGGTGCGGCGCTGCAAGGACCGCCGCCGCCTCATGAAGGAGGCTGTCTACTCCCGCCACCACCTCGCCGCCGCGCACTCCGATTACTGCCGCTCCCTCCGCATGACCGGCTCCGCCCTCGTCACATTCGCCTCCGGCGAAGCCTTCTCTATTTCCGACCACGCCCCCGCCGTCCTCCGCCGCACTCCCACCACCCCACCTTCTACCCCCCCGCCGCCCCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805492.1
MGCTPSKLDNEDTVRRCKDRRRLMKEAVYSRHHLAAAHSDYCRSLRMTGSALVTFASGEAFSISDHAPAVLRRTPTTPPSTPPPPPMSTHRHHKPPRRRRQQPIKLPHILSDSSFTSSPPPNHNFTYNARPNSTYSTTPSQTSSIWNWEHLHPPPSPPDSEFFDQLNQNGAPTNQNDDDSTSSSSDDHPYVDNDDKASTITSNSNQNPYGKQFDDLQSNYSVYSRRSEINQTRKRREAGGEETEREEIECSEWGDHDHDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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