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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003722`

染色体: Chr04 坐标: 53565858-53570442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003722`
名称	SmilChr04G003722
描述	COP9 signalosome complex subunit 7-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53565858 - 53570442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020598`
GeneID	`131020598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020598`
原始查询	`LOC131020598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 7-like
产物	COP9 signalosome complex subunit 7-like
Arabidopsis	`AT1G02090` (FUS5) Proteasome component (PCI) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839241] identity=74.4; qcov=0.961; evalue=5.58e-124; confidence=high
Rice	`Os07g0490800` - identity=71.7; qcov=0.427; evalue=8.08e-50; confidence=low
GO	GO:0008180 (COP9 signalosome)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI); PF22061 (CSN7_HB_subdom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805496.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805497.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805496.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805496.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53566225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:53566273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C53,C80
`Chr4:53566360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:53568568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805496.1

259 aa

130

259

CSN7_HB_subdom

PCI

PF22061 CSN7_HB_subdom 14-43 aa PF01399 PCI 82-155 aa

XP_057805497.1

247 aa

124

247

CSN7_HB_subdom

PCI

PF22061 CSN7_HB_subdom 14-43 aa PF01399 PCI 82-155 aa

XP_057805498.1

246 aa

123

246

CSN7_HB_subdom

PCI

PF22061 CSN7_HB_subdom 14-43 aa PF01399 PCI 82-155 aa

XP_057805499.1

232 aa

116

232

CSN7_HB_subdom

PCI

PF22061 CSN7_HB_subdom 14-43 aa PF01399 PCI 82-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805496.1`	Pfam	`PF22061`	CSN7_HB_subdom	Repeat	14	43	1.9e-05	25.2	CSN7 helical bundle subdomain
`XP_057805496.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1.9e-07	31.9	PCI domain
`XP_057805497.1`	Pfam	`PF22061`	CSN7_HB_subdom	Repeat	14	43	1.7e-05	25.3	CSN7 helical bundle subdomain
`XP_057805497.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1.2e-07	32.5	PCI domain
`XP_057805498.1`	Pfam	`PF22061`	CSN7_HB_subdom	Repeat	14	43	1.7e-05	25.3	CSN7 helical bundle subdomain
`XP_057805498.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1.6e-07	32.1	PCI domain
`XP_057805499.1`	Pfam	`PF22061`	CSN7_HB_subdom	Repeat	14	43	1.6e-05	25.4	CSN7 helical bundle subdomain
`XP_057805499.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	82	155	1.5e-07	32.2	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949513.1
TCTGGATTGTTTGTGTGTATTTTTCTTTCTAAAAAGTAGCATCATCTTCATCTATATTAATATTTGTATACAGTATATTACTGCAATTTTACATACGTGTTGATCTGGATGCTTCCTATATGAAGAGCTACACACACTGCAAACACTAAAGCAGAAAAACAAATCCATTGCATTCTTTCTACAACAAAAGGGGGACTCCAAATCCCCAAGCCCTAAACTTTGATCACTCAAACCCTAGTCTCTCATTGTTTTCTTCAATC...

XM_057949516.1
TCTGGATTGTTTGTGTGTATTTTTCTTTCTAAAAAGTAGCATCATCTTCATCTATATTAATATTTGTATACAGTATATTACTGCAATTTTACATACGTGTTGATCTGGATGCTTCCTATATGAAGAGCTACACACACTGCAAACACTAAAGCAGAAAAACAAATCCATTGCATTCTTTCTACAACAAAAGGGGGACTCCAAATCCCCAAGCCCTAAACTTTGATCACTCAAACCCTAGTCTCTCATTGTTTTCTTCAATC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020598
ATGGACATTGAAGAAAGGCAGGCGGAGCACATAGACTATTTTGTGAAGAAGGCTTCCACTCTGAAGGGCCCGGCACTAGCAAACATCGTCGTTGAGGCCACTTCGCACCCCTTCCTCTTTGCTTTCTCTGAGATTCTCGCTGTTCCTAGTATTCTCGAGCTTGAAGGAACTGAGAATAGTGCCTCCCTTGATTTGCTTCGCATGTTTGCACATGGTACTTGGAGTGAATATAAGAATGTTGCTGACCGTCTTCCAAAATT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805496.1
MDIEERQAEHIDYFVKKASTLKGPALANIVVEATSHPFLFAFSEILAVPSILELEGTENSASLDLLRMFAHGTWSEYKNVADRLPKLLPDQILKLKQLTVLTLAETNKVLPYDTLMQELDVSNVRELEDFVINDCMYVGIVRGKLDQLRRCFEVQFAAGRDIRPGQLGSMIDILANWLTTSDNLLVSIQEKIKWADSMGEMDKKHKKEIDERVEEVKKTLSLKADIDYRGHEGNFSELGGVMDYDQDRNRPKRRRHPIG

XP_057805497.1
MDIEERQAEHIDYFVKKASTLKGPALANIVVEATSHPFLFAFSEILAVPSILELEGTENSASLDLLRMFAHGTWSEYKNVADRLPKLLPDQILKLKQLTVLTLAETNKVLPYDTLMQELDVSNVRELEDFVINDCMYVGIVRGKLDQLRRCFEVQFAAGRDIRPGQLGSMIDILANWLTTSDNLLVSIQEKIKWADSMGEMDKKHKKEIDERVEEVKKTLSLKKLQTVSRQTLTTEGMKGTFLNWEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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