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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001778`

染色体: Chr01 坐标: 32666672-32668220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001778`
名称	SmilChr01G001778
描述	myb-related protein 330-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32666672 - 32668220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020599`
GeneID	`131020599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020599`
原始查询	`LOC131020599`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb-related protein 330-like
产物	myb-related protein 330-like
Arabidopsis	`AT4G09460` (MYB6) myb domain protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826530] identity=61; qcov=0.706; evalue=4.82e-90; confidence=high
Rice	`Os05g0429900` (R2R3-MYB) - identity=54; qcov=0.842; evalue=1.06e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805502.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805502.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805502.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805502.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805502.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32667138`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B32,D7
`Chr1:32667138`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B32,D7
`Chr1:32667449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B55,D6
`Chr1:32667749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:32667753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:32667804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:32667819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:32667822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:32667876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B121,B13,C64,C66
`Chr1:32667903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B121,B5,C79
`Chr1:32667921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B17,B73,C45,C54
`Chr1:32667937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B30,B81,C59,C6,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805502.1

323 aa

162

323

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 70-117 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 73-131 aa PF00249 Myb_DNA-binding 123-167 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 126-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805502.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	70	117	1.9e-37	127.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805502.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	73	131	1.1e-22	80.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805502.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	123	167	1.9e-37	127.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805502.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	126	171	1.1e-22	80.7	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949519.1
AAAGTTCGAGAACACCACACACATATATATACGTACAACACATGTATGTGAAACACACACACATATATATACGTACAACACATGTATGTATACGTGCAGTTCCATACTGCCAAATTTCCAATCAATAATGAATATACATACATTGAATTAATTAAAAAAAGAAAAGGAGGGCAGAAAAGAAAGCCAACTCATCCGTTAAAGCGTACCTACCTACCGAATCCAACCCCATCTTTAACTACTTGTCTTTTTCATCAACTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020599
ATGGTAATCTCTCCCTCTCCCTCTCTTAAATATCCCCTTCTTCTCTTCACCTTCAAGTCTCATCATCACCCCACCCCACCCCCCAATATATATACATGTATATCAAGAACCTTAGTTTTCCACAGACTTTTTAATTTCAACAAGAAAAAGGGATTAATTCTTGAATTCATGGGGCGGTCGCCTTGTTGCGAGAAAGCTCACACCAATAAAGGTGCGTGGACTAAAGATGAAGATCAACGCCTCATCAATTACATACGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805502.1
MVISPSPSLKYPLLLFTFKSHHHPTPPPNIYTCISRTLVFHRLFNFNKKKGLILEFMGRSPCCEKAHTNKGAWTKDEDQRLINYIRAHGEGNWRSLPKAAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNFTEEEDEIIIKLHSLLGNRWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLISSGVDPQTHRPLNSTAAAAAAATITRLDFRNSAPPPPSKEANSSSAHDTNCNSTTTEESQAPPRPREEESGDAVDLELSIGLPSQSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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