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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003727`

染色体: Chr04 坐标: 53603012-53605493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003727`
名称	SmilChr04G003727
描述	transcription termination factor MTEF18, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53603012 - 53605493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020604`
GeneID	`131020604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020604`
原始查询	`LOC131020604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTEF18, mitochondrial
产物	transcription termination factor MTEF18%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G60400` (SHOT1) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825211] identity=45.7; qcov=0.955; evalue=1.03e-165; confidence=high
Rice	`Os07g0409400` (P0492E07.119) - identity=34; qcov=0.977; evalue=3.59e-101; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805506.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805506.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805506.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805506.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53603120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53603195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:53603321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B4,B61,C50,C67
`Chr4:53603330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:53603570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B16
`Chr4:53603603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53603615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53603943`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B18,B40,B81,C27,C51,C52
`Chr4:53603944`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B18,B40,B81,C27,C51,C52
`Chr4:53603993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,C44,C83
`Chr4:53604082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,C44,C83
`Chr4:53604087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C46,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805506.1

557 aa

278

557

mTERF

PF02536 mTERF 242-343 aa PF02536 mTERF 403-537 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805506.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	242	343	3.4e-28	99.2	mTERF
`XP_057805506.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	403	537	3.4e-28	99.2	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949523.1
TGAGTGAGGCATGGCTTATGGGTTTTTGAGTTGCAATTATTTATGAGAATCCCAATTTCCCAATCTTTAAACCCTGGCTATGCTGCTCCACCGAACCACCGCAGCTGCCGCCGTCGTATTCCACCGCACCACCACCAAAATCTCCCTACTCCTCTTCTCCACCTCTACCGCCCCAAAACCCTTCGCCAAAATCCCATGGAAATACAGGTCCAAAGCCATCCAAGAATCGCAGGCAGCGCTTCTAGACTACCTTCACACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020604
ATGCTGCTCCACCGAACCACCGCAGCTGCCGCCGTCGTATTCCACCGCACCACCACCAAAATCTCCCTACTCCTCTTCTCCACCTCTACCGCCCCAAAACCCTTCGCCAAAATCCCATGGAAATACAGGTCCAAAGCCATCCAAGAATCGCAGGCAGCGCTTCTAGACTACCTTCACACAACTCGCGCTCTGCCTTTTCTCTACGCTGACCACATTTCCAGAAATTCGCCCCAATGTCTCTCGAAAGTCGTATCCAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805506.1
MLLHRTTAAAAVVFHRTTTKISLLLFSTSTAPKPFAKIPWKYRSKAIQESQAALLDYLHTTRALPFLYADHISRNSPQCLSKVVSKVPFSPSNFLCSFQRFLRYHPINELEFLLESIGLNCDENETARDILPKNTFFISDWKRFDVVCALGGMGFPWRKLGLLCRDDCSIFGVDPSHLERRIGEIKGIGFNGVSVISIALAFPQVLYSNADGLLGDLKLLMLDYDLLSAVDGNVDTVLEVCEKIKLFYDLGCEMGKVGEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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