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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003865`

染色体: Chr04 坐标: 54565330-54570474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003865`
名称	SmilChr04G003865
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 7
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54565330 - 54570474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020646`
GeneID	`131020646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020646`
原始查询	`LOC131020646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 7
产物	conserved oligomeric Golgi complex subunit 7
Arabidopsis	`AT5G51430` (EYE) conserved oligomeric Golgi complex component-related / COG complex component-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835217] identity=72.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0669600` - identity=70.2; qcov=0.212; evalue=7.94e-75; confidence=weak
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0017119 (COG complex)
KEGG	-
Pfam	PF10191 (COG7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805575.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057805575.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805575.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.40000	`XP_057805575.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805575.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54565567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:54565997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B97,C40
`Chr4:54566507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C25,C57,C8
`Chr4:54566604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B136,B97
`Chr4:54566673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:54566759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B136,B97,C77
`Chr4:54566878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:54566940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54567009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C70
`Chr4:54567430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B113,B7,C32,C68
`Chr4:54567448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B7,C32,C68
`Chr4:54568744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805575.1

839 aa

420

839

COG7

PF10191 COG7 4-835 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805575.1`	Pfam	`PF10191`	COG7	Repeat	4	835	2.9e-254	846.7	Golgi complex component 7 (COG7)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949592.1
GACACATAACTCATTTGCAATATTCTTCAAATTAAAAAACTTAGATATACAATGTGTCGCGTTTAGGTGCCGCGCTTTAGGCGTAAATGCGATTTCAGGAACAATCTTGGCTGGAGCCGGTGGAGCTCAAATTCTCCAAACGATTTGATCCGTACGAGAAAAACAGCAAACCGGCAAGATGATGGTGGATCTCAGCTCCTTCTCGGAGGAGAAATTCGACCCTAAAAAATGGATCAACGGCGCCGTTCAGCAGCGGCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020646
ATGATGGTGGATCTCAGCTCCTTCTCGGAGGAGAAATTCGACCCTAAAAAATGGATCAACGGCGCCGTTCAGCAGCGGCACCCGCAGGATCCCGTCGAGAAGCATCTCGTCGATCTGGAGATGAAGCTGCAGATGGTGTCCGAGGAGATCGCCGCCTCTCTCGAGGAGCAGAGCTCCGCTGCGCTCCTCCGCGTCCCCCGCGCCTCCCGCGACGTCCTCCGCCTCCGTGACGACGCGCTCTCCCTCCGCTCATCCGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805575.1
MMVDLSSFSEEKFDPKKWINGAVQQRHPQDPVEKHLVDLEMKLQMVSEEIAASLEEQSSAALLRVPRASRDVLRLRDDALSLRSSVASILISLKKAEGSSAESITALAKIDTVKRRMEAAYETLQDAAGLTQLSSTVEDVFASGDLSRAAETLANMRHCLTAVGEVAEFANIRKQLEVLEDRLDSMVQPRLTDALNNKKANVAQEMRGILIRIGRFKSLENCYSKVHLRPIKKLWEDFDLRQQSSKLANEKNEVEQFSRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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