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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003806`

染色体: Chr04 坐标: 54240066-54243694 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003806`
名称	SmilChr04G003806
描述	subtilisin-like protease SBT4.14
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54240066 - 54243694 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020650`
GeneID	`131020650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020650`
原始查询	`LOC131020650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT4.14
产物	subtilisin-like protease SBT4.14
Arabidopsis	`AT4G00230` (XSP1) xylem serine peptidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827949] identity=64.5; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0479900` (OsSub58) - identity=42.5; qcov=1.01; evalue=5.38e-177; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057805586.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057805586.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057805586.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805586.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54240131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:54240162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr4:54240176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B64,B69,C14
`Chr4:54240212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B44,B64,B69
`Chr4:54240227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:54240230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54240367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54240369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B82,B86,C67,C86
`Chr4:54240413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B82,B86,C67,C86
`Chr4:54240415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54240554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:54240607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B60,B80,B93,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805586.1

764 aa

382

764

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 53-129 aa PF00082 Peptidase_S8 151-601 aa PF17766 fn3_6 659-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805586.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	53	129	8.2e-15	56.0	Peptidase inhibitor I9
`XP_057805586.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	151	601	4.4e-48	164.8	Subtilase family
`XP_057805586.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	659	758	1.4e-24	86.8	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949603.1
TTCTCCTCATGCCTTCACCTACATCCTATTTATATGTCCCAACAACTCTTGTCAAATTACATGCACACACATGTTCCTCTCATATGCAGCAGTCCTCTTACTATGTCGATGAACAGCCGCCGTCGTCCGCCTCTTCTCCTACTCTACGTCGTCTTTGCAAGCGCCGTAGCTGCACAGGAGAATGACTTCTACATAGTTTTCTTGAGAGACGGAGCCTCGAGCGAGAGATTGCTCGAGACACACCTCAATGTCCTCTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020650
ATGTCCCAACAACTCTTGTCAAATTACATGCACACACATGTTCCTCTCATATGCAGCAGTCCTCTTACTATGTCGATGAACAGCCGCCGTCGTCCGCCTCTTCTCCTACTCTACGTCGTCTTTGCAAGCGCCGTAGCTGCACAGGAGAATGACTTCTACATAGTTTTCTTGAGAGACGGAGCCTCGAGCGAGAGATTGCTCGAGACACACCTCAATGTCCTCTCATCATTGAAGGGAAGTGTGAATGAGGCTTCGGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805586.1
MSQQLLSNYMHTHVPLICSSPLTMSMNSRRRPPLLLLYVVFASAVAAQENDFYIVFLRDGASSERLLETHLNVLSSLKGSVNEASESLVYSYTKSFNAFAAKLSRDEATKLSNMEEVVSILPNRYHKLHTTKSWEFVGLTPNSRRNSKVESNIIVGLLDTGITPDSDSFKDDGLGPPPAKWKGCCAHSANFSGCNNKLIGAKYFKLDKRPDPDDIMSPLDTDGHGTHTSSTLAGVPVPNANLGGLARGTARGAVPRARVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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