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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003818`

染色体: Chr04 坐标: 54329480-54333207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003818`
名称	SmilChr04G003818
描述	shaggy-related protein kinase alpha-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54329480 - 54333207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020674`
GeneID	`131020674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020674`
原始查询	`LOC131020674`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shaggy-related protein kinase alpha-like
产物	shaggy-related protein kinase alpha-like
Arabidopsis	`AT4G00720` (SK32) shaggy-like protein kinase 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828023] identity=71.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0521700` - identity=71.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805631.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057805631.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805631.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805631.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54329949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B89
`Chr4:54330686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:54330865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B29,B54
`Chr4:54330867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,B70,C26,C5
`Chr4:54331315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B54,C14,C27,C42
`Chr4:54331521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B29,B54
`Chr4:54331693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B124
`Chr4:54331694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B69
`Chr4:54331753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54331868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54331940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr4:54331981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805631.1

469 aa

234

469

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 138-421 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 140-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805631.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	138	421	2.6e-62	211.3	Protein kinase domain
`XP_057805631.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	140	341	8.7e-24	84.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949648.1
CGGAAAGGATGATGATTAGCTTTGAAGGTTTGACTGGAGGAAAATAAATTAGTGCTGCTTTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGATTTTATCTGTCTTTATTTTTCTTGGAATTTCTTTTCTACCTTTTCCCTTTTTTTGGTTTCGGTTTCTCTCTTTTATTTCTCTCTCTCTTCTCTTGTTTCTGTTTTGAACGCAGGGAAGAAAGAGAGAGAGAGGAAAAAGAAAATACGCACATTTTCCCTTTTTTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020674
ATGAATATGATGCGGCGGCTGAAGAGCATTACTTCCGGCCGCTCCTCCGTTTCAGATCCTGGTGGGGAGCCTAGCACTATTAAGAGGGTGAAGGTGGAGCAAGAAATCGATCTGATAGGGACGGTAGAGAACAGTATGAGGGATCCGGAGCAGCACAGCGATGACAATGGCACTTTAGAAGCATCATCTAGTAGTCATGATGATAGAGGCGACAAGTCTGGCTACGATGAACTTCCCAAGGAAATGAATGAGATGAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805631.1
MNMMRRLKSITSGRSSVSDPGGEPSTIKRVKVEQEIDLIGTVENSMRDPEQHSDDNGTLEASSSSHDDRGDKSGYDELPKEMNEMKIRDDNKTGGDNEESVKDVEPTVISGNGTETGQIIVTSVGGRNGKPKQTMSYMAERVVGTGSFGVVYQAKCLETGESVAIKKVLQDRRYKNRELQIMQLLSHPNVVQLKHSFYSTTEKNEVYLNVVLEFVPETVYRASRHYSRVNQYMPVFYVQLYVYQICRALNYIHRVIGVCH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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