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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001736`

染色体: Chr01 坐标: 31955859-31957094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001736`
名称	SmilChr01G001736
描述	uncharacterized SmilChr01G001736
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31955859 - 31957094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020690`
GeneID	`131020690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020690`
原始查询	`LOC131020690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.8; qcov=0.89; evalue=1.44e-12; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.8; qcov=1; evalue=6.93e-22; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805662.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805662.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805662.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805662.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31955918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C6,C70,C86
`Chr1:31955927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:31955930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C6,C86
`Chr1:31955939`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A2,B126
`Chr1:31955939`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A2,B126
`Chr1:31955942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B126
`Chr1:31955976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B132,B67
`Chr1:31956016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B97,C18,C69,C73
`Chr1:31956027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A9,C84
`Chr1:31956033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B126
`Chr1:31956047`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A5,A7,B111,B121,B125,B132,B136,B21,B61,B81,B85,B94,C23,C29,C42,C59,C60,C64,C65,C66,C72,C81
`Chr1:31956084`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A7,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805662.1

227 aa

114

227

SWIM

PF04434 SWIM 87-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805662.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	117	1.6e-08	34.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949679.1
AAGGACGGCAACAAGAGTTTATTCCCACTCGCGAATGGTGTTGGCCCGAAAGAGAACGATGAATCGTGGATGTATTTCATGTCGCACATTCGACGTGTTTATGGCCAAGCCAATCCACTTTTGATTGTCTCTGATCAACATATCTCCATTGCCAATGCTATCAGGAATGAGTTACCAAATGCCACCCACGGCCTATGCTACTACCATTTGCAAAATAACTTGAAGCATTACGGTAAGGCAGTGGTAGAGGTGTATCGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020690
ATGACATCAAATGCTGCTGAAGCTTTTAATGCCAGATTGTTGTGGGCAAGAAGACTTCCTATCTGCTCAATGTTAGAGACAATCAGACTTGTTATTGAGAAATGGTTCAGCGAGCGACTAAGGGCTGCACAACAAAACGAGGAAGTCTTGACTGCTGAGGCCGGTAAAAGGGTAGCTATTAAAGTCCAAAAAAGTCGTCGATACACTGCACAAAGGTTGAGTGGCCGGAAGTATAAGGTGCAAACTGCTGACAGAAGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805662.1
MTSNAAEAFNARLLWARRLPICSMLETIRLVIEKWFSERLRAAQQNEEVLTAEAGKRVAIKVQKSRRYTAQRLSGRKYKVQTADRSFKVDLEKKKCECRAFQLDQLPCSHSIAAISEAGDTIAEYVDSYYTNEFLIDTYSGEVNNLLPRYQWLVPEYIAESVVLPLIVKGQSGRPKEGRHRGGGEGSNTQANESSSIRRRKPKKCSICHEEGHSKITCAGRATEPRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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