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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003831`

染色体: Chr04 坐标: 54377729-54380939 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003831`
名称	SmilChr04G003831
描述	uncharacterized SmilChr04G003831
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54377729 - 54380939 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020703`
GeneID	`131020703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020703`
原始查询	`LOC131020703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0640200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0640200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0640200` - identity=54.4; qcov=0.848; evalue=1.2e-72; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24649 (DUF7642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057805674.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057805675.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057805674.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057805675.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057805675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54378203`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B127,B140,B29,B54
`Chr4:54378203`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B127,B140,B29,B54
`Chr4:54378252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B136
`Chr4:54378263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B23,B28,B87,C51
`Chr4:54378337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B99
`Chr4:54378337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:54378345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B30
`Chr4:54378535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B2,B55,C23,C8
`Chr4:54378545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B58,C37,C4,C77
`Chr4:54378562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B67,B68,C39
`Chr4:54378585`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr4:54378585`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805674.1

289 aa

144

289

DUF7642

PF24649 DUF7642 90-189 aa

XP_057805675.1

282 aa

141

282

DUF7642

PF24649 DUF7642 90-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805674.1`	Pfam	`PF24649`	DUF7642	Domain	90	189	2.9e-41	140.2	Domain of unknown function (DUF7642)
`XP_057805675.1`	Pfam	`PF24649`	DUF7642	Domain	90	189	3.2e-41	140.1	Domain of unknown function (DUF7642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949692.1
TGGAGAGCATATTTCAGTTTGAAATGTTTTATGTAATTGGAATATCCCTTTTTCTTTTGGCTGCTGTATTCTTCTTCTTCTTTTCCCTCCAGGATTTTTCTGGTAATTTTGGGCATTAATTGAGAAGGAAATATAGCAAAGATCCGGAAATTTGAAGCACAAACCTGAGTCGATACATGAGCCAACGGATTTAGCTCAAAAAATGCTGATGGGTCGTGCTGAGGGGCTGCTGAAGCTTAATTCTGAGAAAAATCTGCTCC...

XM_057949691.1
ATGTTTTATGTAATTGGAATATCCCTTTTTCTTTTGGCTGCTGTATTCTTCTTCTTCTTTTCCCTCCAGGATTTTTCTGGTAATTTTGGGCATTAATTGAGAAGGAAATATAGCAAAGATCCGGAAATTTGAAGCACAAACCTGAGTCGATACATGAGCCAACGGATTTAGCTCAAAAAATGCTGATGGGTCGTGCTGAGGGGCTGCTGAAGCTTAATTCTGAGAAAAATCTGCTCCTTTCCGATTCCGGCTCTGAGCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020703
ATGCTGATGGGTCGTGCTGAGGGGCTGCTGAAGCTTAATTCTGAGAAAAATCTGCTCCTTTCCGATTCCGGCTCTGAGCTTGAAGCCGATGAAGAAGCTGATAATCCTCCGAGAGTACTGTACGCTGCTTCGTTCGACGAACTCGCATCGAAACATGTTAATTATGATACGATAATATGGCTCTCGATATCTCTGTTACTAGTTTTGGCTTGGGGTGTTGGGATAATTATGCTGCTTTATTTGCCCTATAGAAGATATGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805674.1
MLMGRAEGLLKLNSEKNLLLSDSGSELEADEEADNPPRVLYAASFDELASKHVNYDTIIWLSISLLLVLAWGVGIIMLLYLPYRRYVLQKDVASRKLHVTSKGIVYKASRPSYIPFLAKRDIEKHVPLGLIIDVIIEQGWLQSLYGLHTFRVESIVHGKAAPVDELQVQGLSNPGLLRKVIVTQASKAIQDTGISWDPNIKVTSESMFRMESLTLGPAVLRSPSSKSTKMIGSPRRALMERKGVVPTDAMLTKLEEVNKS...

XP_057805675.1
MLMGRAEGLLKLNSEKNLLLSDSGSELEADEEADNPPRVLYAASFDELASKHVNYDTIIWLSISLLLVLAWGVGIIMLLYLPYRRYVLQKDVASRKLHVTSKGIVYKASRPSYIPFLAKRDIEKHVPLGLIIDVIIEQGWLQSLYGLHTFRVESIVHGKAAPVDELQVQGLSNPGLLRKVIVTQASKAIQDTGISWDPNIKVTSESMFRMESLTLGPAVLRSPSSKSTKMIGSPRRALMERKGVVPTDAMLTKLEEVNKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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