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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003834`

染色体: Chr04 坐标: 54386923-54390307 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003834`
名称	SmilChr04G003834
描述	phosphomannomutase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54386923 - 54390307 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020713`
GeneID	`131020713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020713`
原始查询	`LOC131020713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphomannomutase
产物	phosphomannomutase
Arabidopsis	`AT2G45790` (PMM) phosphomannomutase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819187] identity=80.9; qcov=1; evalue=2.7e-153; confidence=high
Rice	`Os04g0682300` (OsPMM) - identity=83; qcov=1; evalue=1.79e-157; confidence=high
GO	GO:0004615 (phosphomannomutase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006013 (mannose metabolic process); GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0009298 (GDP-mannose biosynthetic process)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03332 (PMM); PF08282 (Hydrolase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805692.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805692.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057805692.1`
4	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057805692.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54388928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54388935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:54389059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54389084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805692.1

246 aa

123

246

Hydrolase_3

PMM

PF08282 Hydrolase_3 11-208 aa PF03332 PMM 29-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805692.1`	Pfam	`PF08282`	Hydrolase_3	Domain	11	208	4.2e-06	27.4	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057805692.1`	Pfam	`PF03332`	PMM	Family	29	244	1.8e-112	375.2	Eukaryotic phosphomannomutase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949709.1
AAACAATAGCAATAGTTATAAAAAGTTAAAAACCAATTGCCACTTCCAACAGCAACTGCCATCCCTTTCAGATCTGCTCTAAAATTTCTCTGAATTTCTCTGTTCATTCAGCTCAGATCTCACTACCTTTTGCTTCATTTACCGAGTTCACCTGATTCTCTCTTTTCAAATTACTGCAGTTTTAGGAAAAGTTTAAATTGATTATGGCTGCAAGAAGACCTGGCGTGATTGCTCTTTTTGATGTCGATGGCACGCTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020713
ATGGCTGCAAGAAGACCTGGCGTGATTGCTCTTTTTGATGTCGATGGCACGCTCACTGCTCCCAGAAAGGGGGCTACTCCTAAGATGTTGGAGTTTATGCGAGACCTTAGAAAGGTTGTAACTATTGGCGTTGTTGGAGGTTCTGATTTTGTTAAGATAGCAGAACAGCTTGGAAAAACAGTTACTGATGACTACGATTATATGTTTGCTGAGAATGGCCTTGTTGCTTACAAGGATGGAAAGTTGATTGGAACACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805692.1
MAARRPGVIALFDVDGTLTAPRKGATPKMLEFMRDLRKVVTIGVVGGSDFVKIAEQLGKTVTDDYDYMFAENGLVAYKDGKLIGTQSLKSFLGEEKLKELINFSLHYIADLDIPIKRGTFIEFRNGMLNVSPIGRNCSQEERDEFEKYDKVHNVRPKMVSVLREKFAQYNLTFSIGGQISFDVFPQGWDKTYCLKYLEEFQEVHFFGDKTYKGGNDYEIYESERTKGHTVTSPDDTIDQCTKLFLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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