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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001751`

染色体: Chr01 坐标: 32246017-32248666 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001751`
名称	SmilChr01G001751
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 29
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32246017 - 32248666 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020715`
GeneID	`131020715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020715`
原始查询	`LOC131020715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 29
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 29
Arabidopsis	`AT3G47810` (MAG1) Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823935] identity=86.3; qcov=0.995; evalue=1.89e-123; confidence=high
Rice	`Os02g0265400` - identity=93.5; qcov=0.969; evalue=2.01e-130; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030904 (retromer complex); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12850 (Metallophos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805698.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805698.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805698.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805698.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32247069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B140,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805698.1

191 aa

191

Metallophos_2

PF12850 Metallophos_2 4-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805698.1`	Pfam	`PF12850`	Metallophos_2	Domain	4	157	9.3e-22	78.4	Calcineurin-like phosphoesterase superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949715.1
TATATTAACTTTTGTTTTTTAAAATATCAAAACAGGCCCCACAAAAAAAAAAAATCTCCATAATCAACTTAGTTCGTTAGCTTAGCTTCGGCGTCATCGATCGAAAGGGGATCTTCCGATGAAGCCCTAATTCCCAATTTCACGAGCAACATCCACCCTCGATTGCTCTCTTTCCGAGTTGGCGACACAGCAGCAGATTCAAGAAAAGAAATAGAAGGTGAGTTGCAACTATCTGAATTGGAGGGATGGTGCTAGTACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020715
ATGGTGCTAGTACTAGCATTAGGTGATTTACACATACCACACAGGGCACCGGATCTGCCTGCAAAGTTTAAATCAATGCTCGTTCCAGGAAAGATCCAGCACGTCATTTGTACGGGCAACTTATGTATCAAAGAGGTTCATGACTACTTGAAAAGTGTTTGTCCAGACTTACACATTACTCGTGGTGAATATGATGAGGACTCACGTTATCCAGATACCAAAACATTAACAATTGGCCAGTTTAAGCTTGGTGTATGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805698.1
MVLVLALGDLHIPHRAPDLPAKFKSMLVPGKIQHVICTGNLCIKEVHDYLKSVCPDLHITRGEYDEDSRYPDTKTLTIGQFKLGVCHGHQVIPWGDLDSLAMLQRQLDVDILVTGHTHQFTAYKHEAGVVINPGSATGAFSSITYDVNPSFVLMDIDGLRVVVYVYELIDGEVKVDKIDFKKTTTPTSLPH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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