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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003836`

染色体: Chr04 坐标: 54401440-54403367 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003836`
名称	SmilChr04G003836
描述	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54401440 - 54403367 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020717`
GeneID	`131020717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020717`
原始查询	`LOC131020717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
产物	LIM domain-containing protein PLIM2c-like
Arabidopsis	`AT3G61230` (PLIM2c) GATA type zinc finger transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825295] identity=68.4; qcov=0.9; evalue=9.78e-108; confidence=high
Rice	`Os04g0532500` (PLIM2B) - identity=70.1; qcov=0.77; evalue=3.57e-92; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057805701.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805702.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057805701.1`
4	Pseudopodium	Pseudopodium	0.40000	`XP_057805701.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54401609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:54401642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:54401928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,C11,C49,C69
`Chr4:54403055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805701.1

240 aa

120

240

LIM

PF00412 LIM 12-68 aa PF00412 LIM 108-164 aa

XP_057805702.1

239 aa

120

239

LIM

PF00412 LIM 12-68 aa PF00412 LIM 107-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805701.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	12	68	3e-25	88.9	LIM domain
`XP_057805701.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	164	3e-25	88.9	LIM domain
`XP_057805702.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	12	68	2.9e-25	89.0	LIM domain
`XP_057805702.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	107	163	2.9e-25	89.0	LIM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949718.1
TGTCTTTGGGAAGAGGGAATTTCTTTAGTTAATTTATTAAATTAATGCAAAAGGTCTTAATTCATCAAAATTAATTAAGCATGGCATCCACTTTCACAGGAACTCTGGATAAATGCAAGGCCTGCGACAAGACTGTTTATTTCGTTGATCTCTTGTCTGCTGATGGCGCCACCTACCACAAATCATGCTTCAAGTGCAGCCACTGCAAGGGCACCCTTGTTATGAGCAACTACTCCTCCATGGATGGCGTGCTCTACTGC...

XM_057949719.1
GTCTTTGGGAAGAGGGAATTTCTTTAGTTAATTTATTAAATTAATGCAAAAGGTCTTAATTCATCAAAATTAATTAAGCATGGCATCCACTTTCACAGGAACTCTGGATAAATGCAAGGCCTGCGACAAGACTGTTTATTTCGTTGATCTCTTGTCTGCTGATGGCGCCACCTACCACAAATCATGCTTCAAGTGCAGCCACTGCAAGGGCACCCTTGTTATGAGCAACTACTCCTCCATGGATGGCGTGCTCTACTGCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020717
ATGGCATCCACTTTCACAGGAACTCTGGATAAATGCAAGGCCTGCGACAAGACTGTTTATTTCGTTGATCTCTTGTCTGCTGATGGCGCCACCTACCACAAATCATGCTTCAAGTGCAGCCACTGCAAGGGCACCCTTGTTATGAGCAACTACTCCTCCATGGATGGCGTGCTCTACTGCAAGACTCATTTCGAACAGCTTTTCAAGGAGTCTGGGAATTTCAGCAAGAATTTTCAAACTGGAAAAGGAGAGAGGGAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805701.1
MASTFTGTLDKCKACDKTVYFVDLLSADGATYHKSCFKCSHCKGTLVMSNYSSMDGVLYCKTHFEQLFKESGNFSKNFQTAGKGERENSLTRAPSKLSAMFSGTQDKCAACSKTVYPLEKMNMEGEPYHKSCFKCAHGGCPLTHSNYAALDGVLYCKHHFQQLFMEKGNYQHVLDAASHKKSASMEAVDVDALAEDAAAAGDEHAEPAAEAAADAAEDEPAKEEEKAADDDDADKTQEQS

XP_057805702.1
MASTFTGTLDKCKACDKTVYFVDLLSADGATYHKSCFKCSHCKGTLVMSNYSSMDGVLYCKTHFEQLFKESGNFSKNFQTGKGERENSLTRAPSKLSAMFSGTQDKCAACSKTVYPLEKMNMEGEPYHKSCFKCAHGGCPLTHSNYAALDGVLYCKHHFQQLFMEKGNYQHVLDAASHKKSASMEAVDVDALAEDAAAAGDEHAEPAAEAAADAAEDEPAKEEEKAADDDDADKTQEQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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