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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003784`

染色体: Chr04 坐标: 53999974-54003677 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003784`
名称	SmilChr04G003784
描述	proteasome subunit beta type-1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53999974 - 54003677 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020722`
GeneID	`131020722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020722`
原始查询	`LOC131020722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit beta type-1
产物	proteasome subunit beta type-1
Arabidopsis	`AT3G60820` (PBF1) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825253] identity=83.9; qcov=1; evalue=2.14e-146; confidence=high
Rice	`Os09g0505600` (OsPBF1) - identity=78.6; qcov=0.987; evalue=2.02e-133; confidence=high
GO	GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805707.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805707.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805707.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805707.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54000267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C5
`Chr4:54000491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:54000786`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A19,A22,A4,B133,B17,B5,B50,B72,B79,B85,C28,C39,C42,C55,C58,C59
`Chr4:54000802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54002081`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr4:54002081`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr4:54002099`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A6,B100,B104,B112,B127,B132,B46,B73,B78,B88,B89,C12,C29,C39,C4,C41,C52,C57,C59,C78,C79,C9
`Chr4:54003262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A10,A11,A5,B100,B108,B113,B12,B126,B134,B18,B2,B22,B23,B28,B3,B31,B32,B33,B35,B47,B48,B55,B56,B6,B60,B66,B70,B81,B96,B98,B99,C18,C2,C20,C24,C33,C47,C56,C57,C58,C61,C62,C63,C65,C67,C75,C80,D1
`Chr4:54003268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:54003289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805707.1

226 aa

113

226

Proteasome

PF00227 Proteasome 13-199 aa

XP_057805708.1

223 aa

112

223

Proteasome

PF00227 Proteasome 13-207 aa

XP_057805709.1

223 aa

112

223

Proteasome

PF00227 Proteasome 13-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805707.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	13	199	4e-35	121.9	Proteasome subunit
`XP_057805708.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	13	207	9.8e-38	130.4	Proteasome subunit
`XP_057805709.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	13	207	9.8e-38	130.4	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949725.1
GTTTTGTGGCTACGACGTCGTACCCTCGCATTGAATTTCTTTCTTGAGAGGAAAGACAGCTTAACAAAAGGGAAGTGCGATTCATCGATTTGAACCCTCAGCAAATTTCATCTCTCGTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCCTGCGATTGATTGTTTGTGTTAGTTGATTCGAGGTCGCGATGCCGAAGCAGCAAGCGAATTGGTCTCCGTACGACAACAATGGAGGGACATGTGTTGCGATTGCCGGAGCTGATTAC...

XM_057949724.1
TACGACGTCGTACCCTCGCATTGAATTTCTTTCTTGAGAGGAAAGACAGCTTAACAAAAGGGAAGTGCGATTCATCGATTTGAACCCTCAGCAAATTTCATCTCTCGTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCCTGCGATTGATTGTTTGTGTTAGTTGATTCGAGGTCGCGATGCCGAAGCAGCAAGCGAATTGGTCTCCGTACGACAACAATGGAGGGACATGTGTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020722
ATGCCGAAGCAGCAAGCGAATTGGTCTCCGTACGACAACAATGGAGGGACATGTGTTGCGATTGCCGGAGCTGATTACTGTGTGATTGCGGCCGATACTCGAATGTCCACTGGCTACAGTATTCTTACTCGCGATTACTCCAAAATTATTCAGCTAGCGGACAAATCTGTGATGGCCTCCTCAGGTTTTCAGGCTGATGTAAGAGCTCTGCAAAAGGTCTTAGCAGCTAGACACTTGCTTTATCAACACCAGCACAACAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805707.1
MPKQQANWSPYDNNGGTCVAIAGADYCVIAADTRMSTGYSILTRDYSKIIQLADKSVMASSGFQADVRALQKVLAARHLLYQHQHNKQMSCPAMAQLLSNTLYFKRFFPYYAFNVLGGLDSEGKGCVFTYDAVGSYERVGYSAQGSGATLITPFLDNQLKSPSPLLLPAKDAVTPLSEVEAIDLVKTCFVSATERDIYTVSLCSLTQAIQLVRPSVMIFLWFTHAL

XP_057805708.1
MPKQQANWSPYDNNGGTCVAIAGADYCVIAADTRMSTGYSILTRDYSKIIQLADKSVMASSGFQADVRALQKVLAARHLLYQHQHNKQMSCPAMAQLLSNTLYFKRFFPYYAFNVLGGLDSEGKGCVFTYDAVGSYERVGYSAQGSGATLITPFLDNQLKSPSPLLLPAKDAVTPLSEVEAIDLVKTCFVSATERDIYTGDKVEMLVLNASGLRREFMDLRKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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